Ampliseq for Illumina Childhood Cancer Panel
AmpliSeq for Illumina Childhood Cancer Panel to zestaw pozwalający na profilowanie wariantów somatycznych powiązanych z nowotworami występującymi u dzieci oraz młodych osób.
Analiza 203 genów powiązanych z nowotworami dziecięcymi
Kompleksowa analiza genów
Zestaw umożliwia analizę takich wariantów genetycznych jak: hotspot, SNVs, CNVs a także fuzje, w 203 genach.
Krótki czas przygotowania bibliotek
Czas przygotowania bibliotek nie przekracza jednego dnia. Ilość materiału wejściowego do protokołu to zaledwie 10 ng wysokiej jakości DNA lub RNA, izolowanego z krwi, szpiku kostnego lub próbek FFPE.
Analiza danych
Zastosowanie lokalnego lub chmurowego oprogramowania bioinformatycznego umożliwia wykrycie mutacji somatycznych, o progu częstości 5%.
Specyfikacja ogólna
Czas preparatyki | 5-6 h |
Czas pracy manualnej | < 1,5 h |
Ilość materiału wejściowego | 10 ng wysokiej jakości DNA lub RNA |
Liczba reakcji | 24 |
Rodzaj materiału wejściowego | Krew, szpik kostny, FFPE |
Kompatybilność z systemami | MiniSeq, MiSeq, MiSeqDx (moduł naukowy), NextSeq 1000, NextSeq 2000, NextSeq 550 |
Rodzaj kwasu nukleinowego | DNA, RNA |
Typy wariantów | CNVs, fuzje genowe, insercje-delecje (indels), SNPs, warianty somatyczne |
Gatunek | Człowiek |
Metodyka | Sekwencjonowanie amplikonowe |
Technologia | Sekwencjonowanie |
Automatyzacja | Automatyczne stacje pipetujące |