SARS-COV-2 NGS DATA TOOLKIT – DARMOWY DOSTĘP
Analiza dużych zbiorów danych, może okazać się skomplikowana bez dostępu do odpowiednich narzędzi. Takich narzędzi, które w sposób intuicyjny poprowadzą nas przez całą ścieżkę biegnącą od surowych plików do finalnego etapu czyli poznania odpowiedzi na postawione pytania.
Aby ułatwić poszukiwanie odpowiedzi na pytania postawione w kontekście pandemii COVID-19, Illumina oferuje darmowy dostęp do niektórych aplikacji, działających w środowisku BaseSpace. Proponowane rozwiązanie zalecane są ośrodkom, które swoje badania skupiają wokół detekcji i identyfikacji SARS-CoV- 2, śledzenia ścieżek pandemii w skali globalnej, określania tempa ewolucji wirusa czy określania czynników mogących mieć wpływ na efektywność stosowanych w przyszłości szczepionek i terapii leczniczych.
Aplikacje, z których można korzystać zupełnie za darmo do końca października 2020, to: DRAGEN RNA Pathogen Detection oraz DRAGEN Metagenomics ułatwiające detekcję SARS-CoV-2, a także SRA Import App i GISAID Submission App pozwalające na udostępnianie efektów swojej pracy w ramach globalnych baz danych.
Idea, która stoi za tym pomysłem, związana jest z potrzebą wymiany wiedzy i międzynarodowej współpracy, której efektem będzie znacznie szersza perspektywa oceny problemu i możliwość przedstawienia najlepszych rozwiązań.