Visium HD Gene Spatial Gene Expression – transkryptomika przestrzenna z rozdzielczością na poziomie pojedynczej komórki!
Obecnie w badaniach biologicznych oraz medycznych technologia tranksryptomiki przestrzennej staje się kluczowym narzędziem, pozwalającym na analizę złożonych procesów z uwzględnieniem ich lokalizacji. Wraz z postępem w tej dziedzinie, badacze zdolni są przenikać przez bariery, które wcześniej ograniczały precyzyjną analizę ekspresji genów w skrawkach tkanek. Jednym z przełomowych rozwiązań jest technologia Visium Spatial Gene Expression, której wykorzystanie przyczyniło się do powstania wielu ważnych naukowych odkryć, udokumentowanych w wiodących publikacjach.
W świecie nauki postęp technologiczny to nie tylko ciągłe poszukiwanie nowych możliwości, ale również nieustanne dążenie do doskonalenia istniejących rozwiązań. W nawiązaniu do tej idei oraz dzięki wytężonym wysiłkom badaczy z 10X Genomics, obszar badań związanych z transkryptomiką przestrzenną wchodzi na kolejny poziom zaawansowania dzięki najnowszej wersji Visium HD SpatialGene Expression. To nie tylko aktualizacja, ale istotny skok jakościowy, który zmienia paradygmat badań nad ekspresją genów na poziomie przestrzennym.
Główną zmianą jest znacznie gęstsze upakowanie, w obszarze roboczym 6,5 x 6,5mm, spotów z unikalnymi oligonukleotydami, służącymi do znakowania transkryptów w skrawkach tkanek. Dzięki zastosowaniu aż 11 000 000 spotów w Visium HD Spatial Gene Expression uzyskano rozdzielczość wskali pojedynczej komórki, co pozwala na lepsze zrozumienie złożonych interakcji genów w kontekście ich lokalizacji w tkankach. Dla porównania, standardowa wersja Visium Spatial Gene Expression wykorzystuje 5000 spotów, każdy o średnicy 55 μm i oddalonych od siebie o 55 μm co pozwala na uzyskanie rozdzielczość w zakresie od 1 do 10 komórek w zależności od analizowanych tkanek. Nowa wersja Visium generuje dane ze znacznie większą rozdzielczością, co oznacza możliwość zagłębienia się w detale badanych tkanek z jeszcze większą precyzją, odkrywając niuanse ekspresji genów na poziomie komórkowym.
Visium HD Spatial Gene Expression działa w połączeniu z urządzeniem Vsium CytAssist, które pozwalana automatyczny transfer sond ze szkiełka podstawowego na szkiełko Visium z naniesionymi unikalnymi sekwencjami oligonukleotydowymi. Obecnie dostępne są zestawy do analizy tkanekFFPE (mysich lub ludzkich). W planach jest wprowadzenie zestawów umożliwiających przestrzenną analizę całego transkryptomu na skrawkach tkanek innych gatunków.
Więcej informacji - https://www.10xgenomics.com/products/visium-hd-spatial-gene-expression