Technologia długich odczytów do Illumina!
Technologia Illumina Complete Long Read, to przełomowe osiągnięcie w dziedzinie genomiki oraz sekwencjonowania następnej generacji, które otwiera ścieżkę do głębszego zrozumienia niedostępnych dotychczas obszarów genomu.
Jest to kompleksowe rozwiązanie integrujące krótkie i długie odczyty na jednej platformie, zapewniające lepsze zrozumienie złożoności całego genomu ludzkiego poprzez holistyczne spojrzenie na informacje genetyczne. Najnowsze narzędzie od Illumina zostało zaprojektowane w oparciu o proces tagmentacji, który jest wykorzystywany do fragmentacji i normalizacji długich odczytów DNA. Pofragmentowane cząsteczki są dodatkowo znakowane, co umożliwia wychwytywanie pojedynczych cząsteczek DNA i generowanie długich odczytów. Takie odczyty są następnie łączone z danymi nieoznakowanymi w celu uzyskania kompleksowych, dokładnych odczytów, gotowych do dalszej analizy.
Illumina Complete Long Reads oferuje następujące rozwiązania na platformach Illumina Novaseq 6000, NovaSeq 6000Dx (RUO) oraz NovaSeq X:
- Illumina Complete Long Read, Human – umożliwiające wykorzystanie długich i krótkich odczytów w całym ludzkim genomie. Protokół cechuje niski wsad materiału wejściowego (50 ng), brak wymagań związanych z metodami izolacji DNA, fragmentacji czy selekcji wielkości.
- Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment, Human – elastyczne i ekonomiczne rozwiązanie zwiększające pokrycie znanych, trudnych do mapowania regionów za pomocą ukierunkowanych długich odczytów tam, gdzie zapewniają one największą wartość. Umożliwia projektowanie niestandardowych paneli za pomocą narzędzia DesignStudio. W ramach procedury uzyskuje się celowane odczyty w zakresie 4-7 kb przy wartości N50 oraz krótkie odczyty w pozostałych regionach genomu.
- Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment i Human Comprehensive Panel - zoptymalizowany panel pokrywający trudne do mapowania regiony w genach kodujących. Panel obejmuje ponad 6500 genów o łącznej wielkości > 90 Mb.