Nowe zestawy do izolacji DNA – MagSi-DNA FFPE (onkologia) oraz MagSi-DNA Stool (metagenomika).
Zestaw MagSi-DNA FFPE jest przeznaczony do izolacji genomowego DNA ze skrawków tkanek FFPE ssaków. Czas przygotowania 96 próbek wynosi około 40 minut bez uwzględniania dodatkowego etapu usuwania parafiny i inkubacji z lizą. Dzięki dostępności protokołów oraz dedykowanych materiałów zużywalnych, rozwiązanie można z łatwością zastosować na urządzeniach typu PurePrep, KingFisher, MagMax lub zoptymalizować na platformach marki Hamilton lub TECAN. Protokoły manualne dostosowane do pracy ze standardowymi separatorami magnetycznymi.
Zestaw nie wymaga ekstrakcji fenolem/chloroformem ani wytrącania alkoholem i eliminuje potrzebę wielokrotnego wirowania, filtracji próżniowej lub rozdzielania na kolumnach. Umożliwia bezpieczne obchodzenie się z potencjalnie zakaźnymi próbkami i zmniejsza prawdopodobieństwo zanieczyszczenia krzyżowego między próbkami. Uzyskane DNA można bezpośrednio wykorzystać do dalszych zastosowań, takich jak PCR, NGS lub wszelkiego rodzaju reakcje enzymatyczne.
Zestaw MagSi-DNA Stool jest przeznaczony do ręcznej i automatycznej izolacji DNA mikrobiomu (mieszaniny DNA bakterii/drobnoustrojów i gospodarza) ze świeżych, zamrożonych lub stabilizowanych próbek kału ludzkiego.
Czas przetwarzania dla przygotowania 96 próbek wynosi około 60 minut, włączając inkubacje z lizą termiczną. Dostępne opcje automatyzacji to między innymi urządzenia PurePrep, KingFisher oraz Hamilton.
Otrzymane DNA można bezpośrednio wykorzystać do dalszych zastosowań, takich jak PCR lub NGS. Kulki magnetyczne MagSi-ST10 będące komponentem zestawu, dostarczane są w buforze do przechowywania w celu zoptymalizowania procesów ponownego zawieszania i zminimalizowania sedymentacji. Roztwory do płukania nie wymagają łączenia z alkoholem i są bezpośrednio gotowe do użycia. W przypadku pracy z próbkami charakteryzującymi się obecnością bakterii trudnych do lizy (np. bakterii Gram-dodatnich) możliwe jest zastosowanie dedykowanych probówek GP Lysis Tubes. MagSi-DNA-Stool można łączyć z zestawami do pobierania próbek – OMNIgene GUT (OM-200) bez dodatkowych optymalizacji.