FusinPlex Dx oraz LiquidPlex Dx z certyfikacją CE-IVD
Firma Inviate (ArcherDX) wprowadziła na rynek europejski nowe, zwalidowane zestawy do sekwencjonowania następnej generacji, działające w oparciu o sprawdzoną technologię Anchored Multiplex PCR (AMP) z certyfikacją CE-IVD.
Dostępne panele zaprojektowano z myślą o laboratoriach które poszukują rozwiązań gwarantujących najwyższą skuteczność w wykrywaniu fuzji, zarówno znanych jak i tych dla których partner fuzyjny nie został zidentyfikowany i opisany we wcześniejszych badaniach (FusionPlex Dx) a także tam gdzie czynnikiem limitującym w skutecznej diagnozie, jest utrudniony dostęp do materiału tkankowego (LiquidPlex Dx). Uzyskane wyniki z wykorzystaniem wspomnianych paneli mogą pomóc w szybkim dopasowaniu najskuteczniejszych terapii lub zakwalifikowaniu do udziału w badaniach klinicznych.
FusionPlex Dx CE-IVD Solid Tumor :
- Skuteczne wykrywanie fuzji w oparciu o RNA z optymalną rozdzielczością, korekcją błędów i zdolnością do identyfikacji nowych partnerów fuzyjnych
- Kompleksowe profilowanie obejmujące 41 genów w tym FGFR, NRG1, MET, NTRK1-3, ALK, ROS, RET
- Markery kluczowe między innymi w niedrobnokomórkowym raku płuc oraz w guzach litych z fuzjami w NTRK1, NTRK2 oraz NTRK3
- Oprogramowanie do analizy wyników oraz generowania raportów
- Kompatybilność z sekwenatorami posiadającymi certyfikację IVD – MiSeqDx oraz NextSeq 550Dx
- Odczynniki w formie liofilizowanej, minimalizujące błędy podczas pipetowania i przygotowywania mieszanin reakcyjnych. Zminimalizowane ryzyko kontaminacji.
- Optymalizacja zestawu pod kątem materiału wejściowego w ilości 10 ng RNA
LiquidPlex Dx : CE-IVD Solid Tumor
- Ukierunkowana identyfikacja SNV oraz InDel w 29 genach w tym między innymi METex14, BRAF,EGFR,ERBB2 (HER2), KRAS oraz FGFR1 oraz dodatkowe biomarkery w kontekście terapii precyzyjnej w chorobach onkologicznych.
- Zestaw ze wskazaniem do diagnostyki niedrobnokomórkowego raka płuc w przypadkach utrudnionego dostępu do biopsji tkankowej lub jako uzupełnienie profilowania w oparciu o materiał tkankowy w celu poszerzenia obrazu heterogenności guza
- 100% czułości dla wariantów METex14, InDel oraz SNV w próbkach przy użyciu 30 ng ctDNA i wartości AF> 0,3%
- Kompatybilność z sekwenatorami MiSeqDx oraz NextSeq 550Dx
Najnowsze zestawy VariantPlex do profilowania guzów litych.
Panele VariantPlex to skalowalne i łatwe w użyciu rozwiązania do sekwencjonowania DNA które można zaimplementować w każdym laboratorium zajmującym się detekcją wariantów somatycznych z wykorzystaniem NGS. Firma Invitae (ArcherDX) oferuje użytkownikom szeroki wybór zestawów w zależności od typów nowotworów a także skali przeprowadzanego badania. Do listy gotowych rozwiązań dołączyły kolejne zestawy zaprojektowane w oparciu o rekomendacje kliniczne, informacje zawarte w specjalistycznej literaturze a także na podstawie opinii specjalistów zaangażowanych w obszary diagnostyki onkologicznej. Dodatkowo, oprócz standardowych wariantów typu InDel, SNV,CNV nowe panele pozwalają analizować wskaźnik MSI (niestabilność mikrosatelitarna).
Nowe panele to :
- VariantPlex Solid Tumor Focus v2 – 20 genów oraz MSI
- VariantPlex Core Solid Tumor – 60 genów oraz MSI
- VariantPlex Expanded Solid Tumor – 76 genów oraz MSI
- VariantPlex Pan Solid Tumor – 185 genów oraz MSI
Każdy z wyżej wymienionych paneli cechuje się szybkim i łatwym protokołem przygotowania bibliotek NGS, minimalnymi wymaganiami dotyczącymi ilości materiały wejściowego, możliwością personalizacji w odniesieniu do analizowanych regionów a także skuteczną korekcją błędów z wykorzystaniem unikalnych molekularnych identyfikatorów (UMI). Panele VariantPlex to również wiarygodna detekcja wariantów w przypadku alleli występujących z niską częstotliwością nawet dla wartości 2,5% w przypadku InDel a także 3% w przypadku SNV oraz analiza statusu MSI (niestabilności mikrosatelitarna) na podstawie 114 loci.
Aby zaspokoić potrzeby użytkowników poszukujących niestandardowych narzędzi do analizy wariantów somatycznych oraz germinalnych, Invitae oferuje dedykowany portal Assay Marketplace gdzie można zapoznać się z dostępnymi, gotowymi panelami a także modyfikować już istniejące oraz budowa
nowe panele od podstaw.
Więcej informacji : https://assay-marketplace.archerdx.com/catalog/VariantPlex