TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Plant
Zestaw TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Plant to proste rozwiązanie dla transkryptomiki roślin. Produkt łączy wszystkie zalety technologii TruSeq RNA z chemią do redukcji rybosomalnego RNA Ribo-Zero. Umożliwia analizę kodującego oraz wielu form niekodującego RNA z precyzyjnym pomiarem orientacji nici, pozwala również na określenie alternatywnych transkryptów, ekspresję antysensownej nici oraz ekspresję allelo-specyficzną.
TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Plant umożliwia szybkie i efektywne usunięcie cytoplazmatycznego, mitochondrialnego oraz chloroplastowego rybosomalnego RNA.
Specyfikacja ogólna
|
Czas preparatyki |
11,5 h |
|
Czas pracy manualnej |
5,5 h |
|
Ilość materiału wejściowego |
0,1-1 ug wysokiej jakości całkowitego RNA ekstrahowanego z roślin |
|
Mechanizm działania |
Deplecja rRNA na kulkach, synteza cDNA oraz PCR |
|
Multipleksowanie |
Od 12 do 96 indeksów (w zależności od typu zestawu) |
|
Kompatybilność z systemami |
HiSeq 2000, HiSeq 2500, HiSeq 3000, HiSeq 4000, NextSeq 1000, NextSeq 2000, NextSeq 500, NextSeq 550, NovaSeq 6000 |
|
Rodzaj kwasu nukleinowego |
RNA |
|
Klasa wariantów |
Fuzje genowe, nowe transkrypty, SNP, warianty transkryptów |
|
Gatunek |
Rośliny |
|
Metodyka |
Sekwencjonowanie całotranskryptomowe |
|
Technologia |
Sekwencjonowanie |
|
Automatyzacja |
Automatyczne stacje pipetujące |