Każda komórka żywego organizmu odgrywa unikalną, niepowtarzalną rolę a jednocześnie jest ściśle skoordynowana z całością co skutkuje powstaniem złożonego układu. Dotychczasowe metody analizy ekspresji genów pozwalały jedynie na uzyskanie uśrednionego wyniku z całej próbki. Ze względu na bardzo dużą heterogenność próbek biologicznych wynik taki mógł być nieprecyzyjny i nie oddawał istoty analizowanej próbki. Aby można było uzyska znacznie większą ilość informacji z analizowanych próbek firma 10x Genomics opracowała platformę Chromium, która umożliwia omiczne analizy w każdej pojedynczej komórce (single cell analysis). Dzięki platformie Chromium możemy uzyskać znacznie więcej informacji/wyników badając heterogenność próbek biologicznych.

Współczesne narzędzia biologii molekularnej, umożliwiające jakościową oraz ilościową analizę transkryptomu pozwoliły na szybki postęp w zrozumieniu procesów biologicznych. Jednakże zastosowanie technik sekwencjonowania lub real time PCR pozwala nam uzyskać tylko uśredniony wynik z analizowanej tkanki. Tracone są bardzo cenne informacje dotyczące heterogenności badanego materiału jak również przestrzennego rozkładu subpopulacji komórek na skrawku tkanki.

Dzięki Xenium dostępne stają się nie tylko dane ilościowe ekspresji poszczególnych genów w pojedynczej komórce ale również przestrzenne rozmieszczenie transkryptów w tkance, z informacją o ich lokalizacji wewnątrzkomórkowej. Próbki biologiczne charakteryzują się wysoką heterogennością w związku z tym klasyczne podejście badania ekspresji z wykorzystaniem real time PCR, sekwencjonowania czy mikromacierzy staje się niewystarczające. Powyższe narzędzia analityczne pozwalaj na uzyskanie jedynie uśrednionego wyniku z całej populacji komórek. Natomiast kluczowych informacji niezbędnych do zidentyfikowania nowych biomarkerów, celów terapeutycznych lub do badania potencjalnych kandydatów na leki poszukiwać należy na poziomie ekspresji transkryptów w poszczególnych komórkach, jak również w przestrzennym ułożeniu subpopulacji komórkowych. Takie nowoczesne podejście dostarczające nam znacznie więcej informacji staje się coraz bardziej powszechne.

Przestrzenna analiza całego transkryptomu bez kompromisów

Atera to przełomowa platforma do przestrzennej analizy ekspresji genów, która umożliwia badanie całego transkryptomu w tkankach, z czułością pojedynczej komórki. System został zaprojektowany do pracy na dużą skalę, oferując jednocześnie wysoką dokładność i automatyzację procesu badawczego.

Dzięki integracji obrazowania, przygotowania próbek i analizy danych w jednym urządzeniu, Atera przyspiesza uzyskiwanie wyników i ułatwia interpretację danych biologicznych.