TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin
Zestaw TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin to proste rozwiązanie dla transkryptomiki z szybką i efektywną procedurą z próbek RNA pochodzących z krwi.
Kompatybilny z próbkami ludzkimi, mysimi i szczurzymi, TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero łączy wszystkie zalety technologii TruSeq RNA z chemią do redukcji rybosomalnego RNA Ribo-Zero. Produkt umożliwia analizę kodującego oraz wielu form niekodującego RNA, z precyzyjnym pomiarem orientacji nici, pozwala również na określić alternatywne transkrypty, ekspresję antysensownej nici oraz ekspresję allelo-specyficzną.
Analiza całotranskryptomowa próbek pochodzących z krwi wymaga usunięcia dwóch form rybosomalnego RNA (cytoplazmatycznego i mitochondrialnego) jak również mRNA globiny, który jest obecny w pełnej krwi w dużej ilości. TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin łączy chemię Ribo-Zero w celu efektywnego usunięcia obu form zbędnego RNA w jednym, szybkim etapie.
Specyfikacja ogólna
Czas preparatyki |
11,5 h |
Czas pracy manualnej |
5,5 h |
Ilość materiału wejściowego |
0,1-1 ug wysokiej jakości całkowitego RNA. |
Mechanizm działania |
Deplecja rRNA na kulkach, synteza cDNA oraz PCR |
Multipleksowanie |
Od 12 do 96 indeksów (w zależności od typu zestawu) |
Kompatybilność z systemami |
HiSeq 2000, HiSeq 2500, HiSeq 3000, HiSeq 4000, NextSeq 1000, NextSeq 2000, NextSeq 500, NextSeq 550, NovaSeq 6000 |
Rodzaj kwasu nukleinowego |
RNA |
Klasa wariantów |
Fuzje genowe, nowe transkrypty, SNP, warianty transkryptów |
Próby specjalne |
Krew |
Gatunek |
Człowiek, szczur, mysz |
Metodyka |
Sekwencjonowanie całotranskryptomowe |
Technologia |
Sekwencjonowanie |
Automatyzacja |
Automatyczne stacje pipetujące |