TruSeq Stranded mRNA
TruSeq Stranded mRNA to prosty, efektywny kosztowo oraz skalowalny zestaw do analizy kodującej części transkryptomu. Zestaw kompatybilny z szerokim zakresem próbek.
Produkt umożliwia precyzyjny pomiar orientacji nici mRNA w celu wykrywania transkrypcji antysensownej, dokładniejszej anotacji transkryptów oraz lepszej efektywności składania sekwencji. Wysoki poziom pokrycia poprawia odczyt alternatywnych transkryptów, genów fuzyjnych czy ekspresji allelo-specyficznej.
Informacja o nici identyfikuje, z której z dwóch nici DNA pochodzi dany transkrypt RNA. Informacja ta zwiększa pewność anotacji transkryptów szczególnie dla prób nie pochodzących z organizmów ludzkich. Identyfikacja pochodzenia nici zwiększa również procent zbieżnych odczytów redukując koszt sekwencjonowania.
Specyfikacja ogólna
Czas preparatyki | 10,5 h |
Czas pracy manualnej | 4,5 h |
Ilość materiału wejściowego | 0,1-1 ug całkowitego RNA lub 10-100 ng mRNA (poliA) |
Mechanizm działania | Kulki opłaszczone oligodT wychwytują ogony poliA |
Multipleksowanie | 1-96 |
Kompatybilność z systemami | HiSeq 2000, HiSeq 2500, HiSeq 3000, HiSeq 4000, NextSeq 1000, NextSeq 2000, NextSeq 500, NextSeq 550, NovaSeq 6000 |
Rodzaj kwasu nukleinowego | RNA |
Klasa wariantów | Fuzje genowe, nowe transkrypty, SNP, warianty transkryptów |
Próby specjalne | Brak kompatybilności z FFPE |
Gatunek | Ssaki, szczur, człowiek, bydło, mysz |
Metodyka | Sekwencjonowanie mRNA |