MaizeLD BeadChip Kit
Analiza 3 000 markerów SNP różnych odmian kukurydzy
Macierz wspierająca uprawę kukurydzy i ocenę odmian. Stworzona z wykorzystaniem próbek z panelu Plant Variety Protection Act.
Zestaw mikromacierzy i odczynników MaizeLD BeadChip należy do grupy produktów agrigenomicznych i pozwala na genotypowanie odmian kukurydzy. Mikromacierze MaizeLD BeadChip zapewniają analizę ponad 3 000 markerów typu SNP na potrzeby opisania profilu EDV (Essentially Derived Varieties).
W porównaniu do tradycyjnych testów wykorzystujących identyfikację markerów SSR, genotypowanie SNP zapewnia wyższą przepustowość, rozdzielczość i powtarzalność, a tym samym wysoką dokładność analizy. Dzięki produktowi MaizeLD BeadChip możliwa jest jednoczesna ocena wszystkich uwzględnionych na tej mikromacierzy markerów EDV dla wielu próbek, co znacznie skraca czas analizy. Genotypowanie kukurydzy z wykorzystaniem mikromacierzy ułatwia szybkie i trafne podejmowanie decyzji dotyczące dalszej uprawy/selekcji wybranych odmian.
Jeśli projekt badawczy dotyczy oceny czystości genetycznej odmiany, opartej o specyficzne markery selekcji lub innych specyficznych zastosowań, możliwe jest „rozbudowanie” macierzy poprzez dodanie puli wskazanych przez użytkownika dodatkowych markerów typu SNP. Do listy markerów podstawowych uwzględnionych w katalogowym produkcie (MaizeLD Bead Chip Kit) możliwe jest dodanie nawet do 70 000 markerów SNP.
Specyfikacja ogólna
Liczba markerów stałych |
3 047 markerów SNP (na potrzeby definiowania odmian EDV) |
Możliwość dodania autorskich marketów |
Do 70 000 markerów SNP wskazanych przez użytkownika (w wersji MaizeLD+ BeadChip Kit , produkt na indywidualne zamówienie) |
Liczba prób na mikromacierzy |
24 |
Wymagana ilość DNA na próbę |
200 ng |
Specyficzność gatunkowa |
Kukurydza |
Kompatybilność z systemami |
iScan, HiScan, HiScanSQ |