Atera
Przestrzenna analiza całego transkryptomu bez kompromisów
Atera to przełomowa platforma do przestrzennej analizy ekspresji genów, która umożliwia badanie całego transkryptomu w tkankach, z czułością pojedynczej komórki. System został zaprojektowany do pracy na dużą skalę, oferując jednocześnie wysoką dokładność i automatyzację procesu badawczego.
Dzięki integracji obrazowania, przygotowania próbek i analizy danych w jednym urządzeniu, Atera przyspiesza uzyskiwanie wyników i ułatwia interpretację danych biologicznych.
Analiza transkryptomu
- Profilowanie ponad 18 000 genów w ramach analizy całego transkryptomu (WTA)
- Możliwość rozszerzenia o dodatkowe panele genów
Rozdzielczość i czułość
- Detekcja transkryptów z precyzją poniżej 30 nm
- Analiza na poziomie pojedynczych komórek w kontekście przestrzennym
Przepustowość
- Możliwość przetwarzania do ~800 próbek rocznie
- Analiza dużych obszarów tkanki w jednym eksperymencie
Panele badawcze
Whole Transcriptome Analysis (WTA)
- Analiza ponad 18 000 genów
- Podejście przeznaczone do badań eksploracyjnych
- Możliwość rozszerzenia o dodatkowy panel (~1000 genów)
Atera Select
- Panele ukierunkowane, obejmujące ≥1000 genów
- Możliwość łączenia paneli w celu zwiększenia zakresu analizy
Projektowanie paneli
- Możliwość tworzenia paneli typu custom
Specyfikacja ogólna
| Typ technologii | Przestrzenna analiza transkryptomu (spatial transcriptomics) |
| Zakres analizy | >18 000 genów (Whole Transcriptome Analysis, WTA) |
| Dodatkowe panele | ≥1000 genów (Atera Select), możliwość łączenia paneli, panele typu custom |
| Rozdzielczość detekcji | <30 nm |
| System kompatybilny z tkankami | FFPE, FF, mikromacierze tkankowe |
| Dodatkowe analizy na tym samym skrawku tkanki | Barwienie H&E, białka powierzchniowe (wkrótce) |
| Przepustowość | do ~800 próbek o powierzchni 1 cm² rocznie (Dla analizy 4 slidów, przy założeniu 4 cm² tkanki na każdy slide.) |
| Liczba szkiełek jednocześnie analizowanych | od 1 do 4 |
| Maksymalna powierzchnia tkanki | do ~2000 mm² / run |
| Czas przygotowania próbki do analizy | 2–3 dni, 4–6 h pracy laboratoryjnej |
| Czas pracy aparatu | 29 h przy wykrywaniu 1000 genów 52 h przy wykrywaniu 2000 genów 75 h przy wykrywaniu 3000 genów (Czas analizy obliczony dla 4 slidów, przy założeniu 4 cm² tkanki na każdy slide.) |