Ampliseq for Illumina Childhood Cancer Panel
AmpliSeq for Illumina Childhood Cancer Panel to zestaw pozwalający na profilowanie wariantów somatycznych powiązanych z nowotworami występującymi u dzieci oraz młodych osób.
Analiza 203 genów powiązanych z nowotworami dziecięcymi
Kompleksowa analiza genów
Zestaw umożliwia analizę takich wariantów genetycznych jak: hotspot, SNVs, CNVs a także fuzje, w 203 genach.
Krótki czas przygotowania bibliotek
Czas przygotowania bibliotek nie przekracza jednego dnia. Ilość materiału wejściowego do protokołu to zaledwie 10 ng wysokiej jakości DNA lub RNA, izolowanego z krwi, szpiku kostnego lub próbek FFPE.
Analiza danych
Zastosowanie lokalnego lub chmurowego oprogramowania bioinformatycznego umożliwia wykrycie mutacji somatycznych, o progu częstości 5%.
Specyfikacja ogólna
|
Czas preparatyki |
5-6 h |
|
Czas pracy manualnej |
< 1,5 h |
|
Ilość materiału wejściowego |
10 ng wysokiej jakości DNA lub RNA |
|
Liczba reakcji |
24 |
|
Rodzaj materiału wejściowego |
Krew, szpik kostny, FFPE |
|
Kompatybilność z systemami |
MiniSeq, MiSeq, MiSeqDx (moduł naukowy), NextSeq 1000, NextSeq 2000, NextSeq 550 |
|
Rodzaj kwasu nukleinowego |
DNA, RNA |
|
Typy wariantów |
CNVs, fuzje genowe, insercje-delecje (indels), SNPs, warianty somatyczne |
|
Gatunek |
Człowiek |
|
Metodyka |
Sekwencjonowanie amplikonowe |
|
Technologia |
Sekwencjonowanie |
|
Automatyzacja |
Automatyczne stacje pipetujące |