10x Xenium
Dzięki Xenium dostępne stają się nie tylko dane ilościowe ekspresji poszczególnych genów w pojedynczej komórce ale również przestrzenne rozmieszczenie transkryptów w tkance, z informacją o ich lokalizacji wewnątrzkomórkowej. Próbki biologiczne charakteryzują się wysoką heterogennością w związku z tym klasyczne podejście badania ekspresji z wykorzystaniem real time PCR, sekwencjonowania czy mikromacierzy staje się niewystarczające. Powyższe narzędzia analityczne pozwalaj na uzyskanie jedynie uśrednionego wyniku z całej populacji komórek. Natomiast kluczowych informacji niezbędnych do zidentyfikowania nowych biomarkerów, celów terapeutycznych lub do badania potencjalnych kandydatów na leki poszukiwać należy na poziomie ekspresji transkryptów w poszczególnych komórkach, jak również w przestrzennym ułożeniu subpopulacji komórkowych. Takie nowoczesne podejście dostarczające nam znacznie więcej informacji staje się coraz bardziej powszechne.
- Human Breast Gene Expression Panel
- Human Brain Gene Expression Panel
- Human Lung Gene Expression Panel
- Human Multi-Tissue and Cancer Gene Expression Panel
- Mouse Brain Gene Expression Panel
- Custom Panels
Sondy zostały zaprojektowane w taki sposób, że komplementarne do wykrywanego genu są końce 5’ i 3’, a pomiędzy końcami znajduje się unikalna sekwencja oligonukleotydowa (barkod). Po hybrydyzacji następuje ligacja końców i namnożenie unikalnej sekwencji oligonukleotydowej. Dzięki takiej konstrukcji sond uzyskano znacznie większą specyficzność. Zastosowana nowoczesna, nieinwazyjna chemia nie powoduje degradacji badanych skrawków i pozwala na ich późniejsze wykorzystanie w dalszych analizach.
- świeżych/mrożonych (FF)
- FFPE
Specyfikacja ogólna
Ilość jednocześnie analizowanych slajdów |
2 |
Maksymalna powierzchnia skrawka |
2,88cm2 (12 x 24mm) |
Rozdzielczość |
0,2 mikronów/pixel |
Precyzja lokalizacji transkryptów |
<50nm |
Czas przygotowania próbek |
około 2 dni w tym 2 godziny pracy laboratoryjnej |
Czas analizy |
do 6 analiz (12 skrawków) na tydzień |
Rodzaj tkanek |
świeża/mrożona, FFPE |
Liczba analizowanych transkryptów |
do 400 transkryptów RNA |