Szybsze przygotowanie bibliotek RNA - portfolio Illumina Rapid RNA Prep
Illumina rozszerza portfolio rozwiązań do przygotowania bibliotek RNA o serię produktów Rapid, opartych na technologii tagmentacji z wykorzystaniem transpozomów związanych z kulkami magnetycznymi (Bead-Linked Transposomes, BLT). Połączenie syntezy cDNA i znakowania adapterami w jednym etapie reakcji skraca zarówno całkowity czas procedury przygotowania biblioteki NGS, jak i preparatyki manualnej, przy zachowaniu zgodności z istniejącymi odczynnikami i oprogramowaniem analitycznym.
Wspólne cechy portfolio Rapid do przygotowywania bibliotek RNA:
- prosty przebieg pracy, idealny do laboratoriów o dużej przepustowości,
- pełna zgodność z odczynnikami i oprogramowaniem, które są znane z innych rozwiązań Illumina,
- istotnie krótszy czas pracy manualnej i całego procesu przygotowania biblioteki.
Illumina Rapid Total RNA Prep
Protokół wykorzystuje 30-minutową reakcję łączącą syntezę cDNA z tagmentacją na kulkach BLT. Cały proces, obejmujący również deplecję rRNA i PCR, trwa około 3,5 godziny. Zestaw umożliwia pracę z wsadem od 1 do 1000 ng RNA, w tym z RNA wyizolowanym z FFPE (w ilości od 10 ng), zapewniając jednorodne pokrycie transkryptomu.
Illumina Rapid mRNA Prep
Kluczowe etapy przygotowania biblioteki zachodzą w jednej probówce, a proces trwa około 3 godzin. Protokół opiera się na wychwytywaniu transkryptów poly(A), zachowuje wysoką złożoność bibliotek i umożliwia pracę z próbkami zawierającymi od 1 ng wysokiej jakości RNA. Zestaw nie jest przeznaczony do pracy z materiałem FFPE.
Illumina Rapid RNA Prep with Enrichment
Rozwiązanie przeznaczone do ukierunkowanych analiz RNA, umożliwiające pacę z próbkami zawierającymi od 1-1000 ng RNA, w tym z RNA wyizolowanym z FFPE (w ilości od 20 ng). Biblioteka jest gotowa do sekwencjonowania po około 6,5 godziny, przy czasie preparatyki manualnej poniżej 1,5 godziny. Szlak wspiera analizy ekspresji genów, detekcję fuzji, małych wariantów oraz izoform splicingowych.