Publikacja – zastosowanie technologii transkryptomiki przestrzennej i wysokoprzepustowego sekwencjonowania następnej generacji w badaniach nad rakiem trzustki.

Nowotwory złośliwe trzustki stanowią 3% wszystkich nowotworów złośliwych u człowieka. Najczęściej występującymi podtypami tego nowotworu są : gruczolakorak przewodowy, torbielakogruczolakorak, rak zrazikowo – komórkowy. W związku z czynnikami wpływającymi na późne wykrywanie tego nowotworu, szybkie przerzuty do innych organów oraz oporność na leczenie, wskaźniki 5-letniego przeżycia są bardzo niskie i np. w odniesieniu do gruczolakoraka przewodowego (PDAC) wynoszą zaledwie 11%. Leczeniem pierwszego rzutu jest zabieg chirurgiczny  a następnie radioterapia i/lub chemioterapia, przy czym opcje immunoterapii są ograniczone.

W ramach konsorcjum Human Tumor Atlas Network, naukowcy przyjrzeli się bliżej jednemu z podtypów nowotworów trzustki określanego gruczolakorakiem przewodowym i w ramach prowadzonych badań przeanalizowali próbki pobrane od 31 pacjentów i wykorzystali w tym celu między innymi takie technologie jak sekwencjonowanie pojedynczych komórek/jąder, proteogenomikę, tranksryptomikę przestrzenną oraz obrazowanie komórkowe. Dzięki przeprowadzonym badaniom, udało się pozyskać wiele wartościowych informacji w tym zidentyfikowano populacje przejściowe i związane z nimi sygnatury molekularne. Wśród istotnych informacji znalazły się również te dotyczące podstruktury guzów, miedzy innymi zidentyfikowano trzykrotne wzbogacenie zapalnych fibroblastów związanych z nowotworem (w próbkach chemioopornych) podnoszących poziom metalotionein.

Dostęp do pełnej publikacji: https://www.nature.com/articles/s41588-022-01157-1