Przedstawiamy najnowsze rozwiązania FusionPlex od firmy Invitae (ArcherDX) z rozszerzonym zakresem analizowanych genów
W ofercie firmy Analityk Genetyka pojawiły się nowe wersje paneli FusionPlex do analizy wybranych wariantów somatycznych, występujących w guzach litych i mięsakach. Panele zostały zaktualizowane w oparciu o rekomendacje instytucji działających w obszarze onkologii precyzyjnej i leczenia ukierunkowanego.
FusionPlex to rozwiązanie od lat doceniane przez specjalistów zajmujących się diagnostyką onkologiczną i badaniami nad poszukiwaniem nowych markerów molekularnych. Kluczowe cechy tego produktu to:
- AMP (Anchored Multiplex PCR) zapewniające wykrywanie mutacji,
- Optymalny czas przygotowywania bibliotek,
- Kompatybilność z materiałem typu FFPE,
- Niska ilość wejściowego RNA wynosząca 10 ng,
- Detekcja zarówno znanych i nowych fuzji genów,
- Szybka i łatwa personalizacja – tworzenie paneli typu custom.
FusionPlex Sarcoma v2
To ukierunkowany panel NGS wzbogacony o dodatkowe regiony w stosunku do wersji pierwotnej, panelu FusionPlex Sarcoma. Nowa wersja obejmuje kluczowe fuzje oraz warianty dla 63 genów istotnych w diagnozie i leczeniu mięsaków. Materiałem wejściowym służącym do przygotowania bibliotek jest RNA. Pozwala to na bardziej ekonomiczne i dokładniejsze wykrywanie fuzji w porównaniu do technik opartych na wzbogacaniu przez hybrydyzację i wykorzystaniu DNA jako materiału początkowego. Dzięki rewolucyjnej technologii AMP, panele w wersji FusionPlex, jako jedne z niewielu dostępnych na rynku, umożliwiają detekcje fuzji znanych i opisanych, ale także tych nieopisanych, z nowymi partnerami fuzyjnymi.
FusionPlex Lung v2
Panel ten jest rozwiązaniem zaprojektowanym na bazie poprzedniej, bardzo dobrze przyjętej i zaadaptowanej przez specjalistów wersji panelu, FusionPlex Lung Kit.
Zmodyfikowana wersja obejmuje swoimi zakresem dodatkowe fuzje oraz izoformy, zaprojektowane na podstawie najnowszych rekomendacji udzielonych przez organizacje takie jak NCCN (National Comprehensive Cancer Network) czy ESMO (European Society for Medical Oncology).
Kluczowe geny podlegające analizie w FusionPlex Lung Kit v2 to:
- ALK, BRAF, EGFR, ERBB2, FGFR1, FGFR2,FGFR3, MET, NRG1, NTRK1, NTRK2, NTRK3, NUTM1, PIK3CA, RET, ROS1 pod kątem fuzji oraz wariantów dotyczących pominięcia exonu,
- KRAS, BRAF, ALK, RET, PIK3CA, ROS1, MET pod kątem wariantów typu SNV/Indel.
Szczegółowy zakres analizy i lista genów znajdują się tutaj: https://archerdx.com/research-products/solid-tumor-research/fusionplex-lung/
FusionPlex Pan Solid Tumor v2
To panel oferujący szeroki zakres analizy. Rozwiązanie to umożliwia detekcję fuzji oraz innych wariantów dla 137 genów, powiązanych z rozwojem guzów litych i mięsaków.
Geny zawarte w panelu to między innymi:
- MDM2, NTRK1, NTRK2, NTRK3, PRKD3, RET, ROS1, JAK3, EGFR, FOS, MET.
Pełną listę genów można znaleźć tutaj: https://archerdx.com/research-products/solid-tumor-research/fusionplex-solid-tumor/
Kolejny panel - Pan Solid Tumor v2 - to niezawodna technologia dająca wiele możliwości w odniesieniu do rodzaju materiału, personalizacji regionów, czy detekcji nowych i nieopisanych fuzji.