TruSight Tumor 170
TruSight Tumor 170 to zestaw zaprojektowany do analizy 170 genów powiązanych z powszechnymi guzami litymi. Panel bazuje na technologii wzbogacania bibliotek i może być wykorzystywany do analizy DNA i RNA, pokrywając szeroki zakres genów i typów wariantów.
Zestaw umożliwia analizę takich wariantów genetycznych jak: fuzje, warianty splicingowe, insercje/delecje (indel), SNVs. Wykorzystanie DNA i RNA zwiększa wydajność analizowanych próbek.
Wykrycie wariantów przy użyciu zaledwie 40 ng DNA i RNA, nawet przy 5% częstości występowania mutacji allelu. Maksymalizacja wyników z próbek FFPE.
Specyfikacja ogólna
|
Czas preparatyki |
~2 dni |
|
Czas pracy manualnej |
~10,5 h |
|
Ilość materiału wejściowego |
40 ng DNA lub RNA |
|
Liczba reakcji |
Do 36 dla DNA (używając obu zestawów indeksów) i do 16 dla RNA |
|
Rodzaj materiału wejściowego |
Próbki o małej ilości materiału wejściowego, FFPE |
|
Kompatybilność z systemami |
HiSeq 2500, NextSeq 2000, NextSeq 500, NextSeq 550 |
|
Rodzaj kwasu nukleinowego |
DNA, RNA |
|
Typy wariantów |
CNVs, fuzje genowe, insercje-delecje (indels), SNVs, warianty somatyczne, warianty strukturalne |
|
Gatunek |
Człowiek |
|
Metodyka |
Celowane wzbogacanie, celowane sekwencjonowanie DNA, celowane sekwencjonowanie RNA |
|
Technologia |
Sekwencjonowanie |