TruSight RNA Pan-Cancer Panel
TruSight RNA Pan-Cancer Panel zapewnia kompleksową analizę transkryptomu nowotworów. Zestaw oferuje:
- Informację o ekspresji genów, wywołanie wariantów, detekcję fuzji genów znanych i nowych partnerów fuzyjnych
- Zoptymalizowany protokół o niewielkiej ilości materiału wejściowego, z szerokiej gamy rodzajów próbek, włączając próbki FFPE
- Wyczerpujące podejście do ścieżek nowotworowych
- Ekonomiczne sekwencjonowanie RNA
Zestaw TruSight RNA Pan-Cancer umożliwia ilościowe pomiary ekspresji genów, jak i wykrycie fuzji genów ze znanymi i nowymi partnerami fuzji genowych. Zestaw toleruje niewielkie ilości materiału wejściowego, jak 10 ng całkowitego RNA lub 20 ng z FFPE.
Analiza może być przeprowadzona używając aplikacji BaseSpace RNA-Seq Aligment. To intuicyjne narzędzie wykonuje wywoływanie fuzji i detekcję wariantów. Zapewnia dostęp do profili ekspresji genów i oferuje wyczerpujące rozwiązanie dla badających nowotwory.
Specyfikacja ogólna
|
Czas preparatyki |
2.5 dni |
|
Czas pracy manualnej |
11 h |
|
Ilość materiału wejściowego |
10 ng całkowitego RNA, 20-100 ng RNA z FFPE |
|
Rodzaj materiału wejściowego |
Próbki o małej ilości materiału wejściowego, FFPE |
|
Kompatybilność z systemami |
MiniSeq, MiSeq, MiSeqDx in Research Mode, NextSeq 500, NextSeq 550, NextSeq 2000 |
|
Rodzaj kwasu nukleinowego |
RNA |
|
Typy wariantów |
Fuzje genowe, warianty somatyczne, nowe transkrypty, warianty transkrypcji |
|
Gatunek |
Człowiek |
|
Metodyka |
Celowane wzbogacanie, celowane sekwencjonowanie RNA |
|
Technologia |
Sekwencjonowanie |