TruSight Oncology UMI Regents

TruSight Oncology UMI Regents

TruSight Oncology Reagents to zestaw zaprojektowany do redukcji szumu tzw. background noise, pozwalając na wykrycie wariantów występujących z niską częstotliwością, takich jak te, występujące w wolno krążącym DNA (cfDNA).

Zmniejszenie wartości błędów

ctDNA może być bardzo niewielką częścią wolno krążącego DNA, pozostając na granicy wykrywalności. TruSight Oncology UMI Reagents zmniejsza wartości błędów poniżej 0,007%, umożliwiając tym samym wykrycie wariantów rzadko występujących.

Integracja z pakietem TruSight Oncology

Zestaw zawiera UMI adaptery oraz indeksy, odczynniki do przygotowania bibliotek i wzbogacania z zestawu TruSight Oncology. Odczynniki te można również stosować wraz z sondami z zestawu TruSight Tumor 170.

Intuicyjne oprogramowanie do korekcji błędów

Aplikacja UMI Error Correction składa odczyty, a następnie wykorzystuje UMI, aby odrzucić fałszywie pozytywne wyniki, zmniejszając tym samym błędy wywoływanych wariantów. Aplikacja UMI Error Correction jest dostępna na BaseSpace Sequencing Hub lub do instalacji lokalnej.

Specyfikacja ogólna

Czas preparatyki

1, 5 dnia

Czas pracy manualnej

5 h

Ilość materiału wejściowego     

30 ng cfDNA

Rodzaj materiału wejściowego

cfDNA, brak kompatybilności z FFPE

Kompatybilność  z systemami   

HiSeq 2500, HiSeq 4000, NextSeq 2000, NextSeq 550, NovaSeq 6000

Rodzaj kwasu nukleinowego

DNA

Typy nowotworów

Różne (Pan-Cancer)

Gatunek

Człowiek

Metodyka

Celowane sekwencjonowanie DNA

Technologia

Sekwencjonowanie

Materiały do pobrania