TruSight Oncology UMI Regents
TruSight Oncology Reagents to zestaw zaprojektowany do redukcji szumu tzw. background noise, pozwalając na wykrycie wariantów występujących z niską częstotliwością, takich jak te, występujące w wolno krążącym DNA (cfDNA).
ctDNA może być bardzo niewielką częścią wolno krążącego DNA, pozostając na granicy wykrywalności. TruSight Oncology UMI Reagents zmniejsza wartości błędów poniżej 0,007%, umożliwiając tym samym wykrycie wariantów rzadko występujących.
Zestaw zawiera UMI adaptery oraz indeksy, odczynniki do przygotowania bibliotek i wzbogacania z zestawu TruSight Oncology. Odczynniki te można również stosować wraz z sondami z zestawu TruSight Tumor 170.
Aplikacja UMI Error Correction składa odczyty, a następnie wykorzystuje UMI, aby odrzucić fałszywie pozytywne wyniki, zmniejszając tym samym błędy wywoływanych wariantów. Aplikacja UMI Error Correction jest dostępna na BaseSpace Sequencing Hub lub do instalacji lokalnej.
Specyfikacja ogólna
|
Czas preparatyki |
1, 5 dnia |
|
Czas pracy manualnej |
5 h |
|
Ilość materiału wejściowego |
30 ng cfDNA |
|
Rodzaj materiału wejściowego |
cfDNA, brak kompatybilności z FFPE |
|
Kompatybilność z systemami |
HiSeq 2500, HiSeq 4000, NextSeq 2000, NextSeq 550, NovaSeq 6000 |
|
Rodzaj kwasu nukleinowego |
DNA |
|
Typy nowotworów |
Różne (Pan-Cancer) |
|
Gatunek |
Człowiek |
|
Metodyka |
Celowane sekwencjonowanie DNA |
|
Technologia |
Sekwencjonowanie |