TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin

TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin

Zestaw do przygotowywania bibliotek do sekwencjonowania z RNA z krwi charakteryzujący się efektywną procedurą usuwania rybosomalnego RNA oraz mRNA globiny w jednym etapie.

Zestaw TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin to proste rozwiązanie dla transkryptomiki z szybką i efektywną procedurą z próbek RNA pochodzących z krwi.

Kompatybilny z próbkami ludzkimi, mysimi i szczurzymi, TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero łączy wszystkie zalety technologii TruSeq RNA z chemią do redukcji rybosomalnego RNA Ribo-Zero. Produkt umożliwia analizę kodującego oraz wielu form niekodującego RNA, z precyzyjnym pomiarem orientacji nici, pozwala również na określić alternatywne transkrypty, ekspresję antysensownej nici oraz ekspresję allelo-specyficzną.

Analiza całotranskryptomowa próbek pochodzących z krwi wymaga usunięcia dwóch form rybosomalnego RNA (cytoplazmatycznego i mitochondrialnego) jak również mRNA globiny, który jest obecny w pełnej krwi w dużej ilości. TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin łączy chemię Ribo-Zero w celu efektywnego usunięcia obu form zbędnego RNA w jednym, szybkim etapie.

Specyfikacja ogólna

Czas preparatyki

11,5 h

Czas pracy manualnej

5,5 h

Ilość materiału wejściowego     

0,1-1 ug wysokiej jakości całkowitego RNA.

Mechanizm działania

Deplecja rRNA na kulkach, synteza cDNA oraz PCR

Multipleksowanie

Od 12 do 96 indeksów (w zależności od typu zestawu)

Kompatybilność  z systemami   

HiSeq 2000, HiSeq 2500, HiSeq 3000, HiSeq 4000, NextSeq 1000, NextSeq 2000, NextSeq 500, NextSeq 550, NovaSeq 6000

Rodzaj kwasu nukleinowego

RNA

Klasa wariantów

Fuzje genowe, nowe transkrypty, SNP, warianty transkryptów

Próby specjalne

Krew

Gatunek

Człowiek, szczur, mysz

Metodyka

Sekwencjonowanie całotranskryptomowe

Technologia

Sekwencjonowanie

Automatyzacja

Automatyczne stacje pipetujące