TruSeq Stranded Total RNA
Zestaw TruSeq Stranded Total RNA to proste rozwiązanie dla transkryptomiki ze skalowalną i efektywną kosztowo analizą całkowitego RNA przez sekwencjonowanie.
Kompatybilny z szerokim spektrum próbek, w tym niskiej jakości DNA/RNA czy FFPE, łączy wszystkie zalety technologii TruSeq RNA z chemią do redukcji rybosomalnego RNA Ribo-Zero. Produkt umożliwia analizę kodującego oraz wielu form niekodującego RNA, z precyzyjnym pomiarem orientacji nici, pokrycia oraz pozwala na określenie alternatywnych transkryptów, fuzji genowych oraz ekspresji allelo-specyficznej.
Zestaw został zaprojektowany dla badań transkryptomu człowieka, myszy oraz szczura ale może być stosowany dla innych gatunków eukariotycznych.
Specyfikacja ogólna
|
Czas preparatyki |
11,5 h |
|
Czas pracy manualnej |
5,5 h |
|
Ilość materiału wejściowego |
0,1-1 ug wysokiej jakości całkowitego RNA. Próby niższej jakości wymagają dodatkowej optymalizacji |
|
Mechanizm działania |
Deplecja rRNA na kulkach, synteza cDNA oraz PCR |
|
Multipleksowanie |
Od 12 do 96 indeksów (w zależności od typu zestawu) |
|
Kompatybilność z systemami |
HiSeq 2000, HiSeq 2500, HiSeq 3000, HiSeq 4000, NextSeq 1000, NextSeq 2000, NextSeq 500, NextSeq 550, NovaSeq 6000 |
|
Rodzaj kwasu nukleinowego |
RNA |
|
Klasa wariantów |
Fuzje genowe, nowe transkrypty, SNP, warianty transkryptów |
|
Próby specjalne |
Tkanki FFPE |
|
Gatunek |
Człowiek, szczur, mysz |
|
Metodyka |
Sekwencjonowanie całotranskryptomowe |
|
Technologia |
Sekwencjonowanie |
|
Automatyzacja |
Automatyczne stacje pipetujące |