TruSeq Stranded Total RNA
Zestaw TruSeq Stranded Total RNA to proste rozwiązanie dla transkryptomiki ze skalowalną i efektywną kosztowo analizą całkowitego RNA przez sekwencjonowanie.
Kompatybilny z szerokim spektrum próbek, w tym niskiej jakości DNA/RNA czy FFPE, łączy wszystkie zalety technologii TruSeq RNA z chemią do redukcji rybosomalnego RNA Ribo-Zero. Produkt umożliwia analizę kodującego oraz wielu form niekodującego RNA, z precyzyjnym pomiarem orientacji nici, pokrycia oraz pozwala na określenie alternatywnych transkryptów, fuzji genowych oraz ekspresji allelo-specyficznej.
Zestaw został zaprojektowany dla badań transkryptomu człowieka, myszy oraz szczura ale może być stosowany dla innych gatunków eukariotycznych.
Specyfikacja ogólna
Czas preparatyki | 11,5 h |
Czas pracy manualnej | 5,5 h |
Ilość materiału wejściowego | 0,1-1 ug wysokiej jakości całkowitego RNA. Próby niższej jakości wymagają dodatkowej optymalizacji |
Mechanizm działania | Deplecja rRNA na kulkach, synteza cDNA oraz PCR |
Multipleksowanie | Od 12 do 96 indeksów (w zależności od typu zestawu) |
Kompatybilność z systemami | HiSeq 2000, HiSeq 2500, HiSeq 3000, HiSeq 4000, NextSeq 1000, NextSeq 2000, NextSeq 500, NextSeq 550, NovaSeq 6000 |
Rodzaj kwasu nukleinowego | RNA |
Klasa wariantów | Fuzje genowe, nowe transkrypty, SNP, warianty transkryptów |
Próby specjalne | Tkanki FFPE |
Gatunek | Człowiek, szczur, mysz |
Metodyka | Sekwencjonowanie całotranskryptomowe |
Technologia | Sekwencjonowanie |
Automatyzacja | Automatyczne stacje pipetujące |