PorcineSNP60 DNA Analysis Kit v2
Analiza różnorodności ras trzody chlewnej
Mikromacierz w formacie 24-próbkowym, umożliwiająca badanie różnorodności genetycznej ras świń w oparciu o genotypowanie ponad 64 tysięcy polimorfizmów.
Zestaw PorcineSNP60 v2 BeadChip jest rozbudowaną macierzą do genotypowania świń, zapewniającą możliwość analizy zróżnicowania genetycznego kluczowych ras hodowlanych, takich jak m.in Duroc, Landrace, Pietrain i Large White. Znajduje również zastosowanie w całogenomowych badaniach asocjacyjnych, określaniu cech dziedziczonych, identyfikacji cech QTL oraz badaniach porównawczych.
Macierz powstała we współpracy z Konsorcjum ekspertów (International Porcine SNP Chip Consortium) i została zoptymalizowana pod kątem doboru markerów, ich lokalizacji, odległości oraz częstotliwości alleli rzadkich (MAF). Efektem jest produkt o dużej gęstośc,i zapewniający jednolite pokrycie całego genomu z uśrednionymi odległościami ok 43,4 kb. Markery SNP zostały zwalidowane dla 7 ważnych ekonomicznie ras hodowlanych.
Wariant PorcineSNP60+ DNA Analysis Kit v2 daje możliwość rozbudowania macierzy o 25 000 dodatkowych markerów SNP i stworzenia autorskiego produktu.
Specyfikacja ogólna
|
Specyficzność gatunkowa |
Świnia |
|
Liczba uwzględnionych markerów |
64 232 markery (SNP z obszaru całego genomu) |
|
Możliwość rozbudowy |
Do maksymalnie 25 000 SNP dla macierzy PorcineSNP60 v2 BeadChip |
|
Wymagana ilość próbki do analizy |
200 ng DNA |
|
Liczba próbek na mikromacierzy |
24 |
|
Dostępne formaty opakowań |
48 próbek 288 próbek 1152 próbek |