NextSeq 1000/2000

NextSeq 1000/2000
NextSeq 1000/2000 – sprawdzona technologia otwierającą drogę do przyszłości.
Sekwenatory NextSeq 1000/2000 to połączenie sprawdzonej technologii SBS z innowacyjnymi rozwiązaniami pozwalające na uzyskiwanie wysokiej jakości wyników, dostępu do szerokiego portfolio aplikacyjnego przy zachowaniu optymalnego poziomu inwestycyjnego.

W sekwenatorach NextSeq 1000 oraz 2000 zastosowano zmodyfikowane płytki przepływowe (flow-cell) charakteryzujące się zwiększoną gęstością klastrów tworzonych podczas amplifikacji mostkowej. Poprzez dodatkowe usprawnienie systemu optycznego, proces obrazowania przebiega z jeszcze większą rozdzielczością i dokładnością zapewniając wysoką jakość otrzymywanych wyników. Kombinacja wspomnianych rozwiązań a także optymalizacja innych współczynników dotyczących np. jasności klastrów, redukcji tła ale również objętości w której odbywa się właściwa reakcja sekwencjonowania, dodatkowo niesie ze sobą pozytywny efekt w postaci obniżenia kosztów w przeliczeniu na 1Gb. Dodatkowo sekwenatory NextSeq 1000 oraz 2000 zostały zintegrowane z wydajną i szybką platformą obliczeniową DRAGEN Bio-IT, która pozwala na drugo- i trzeciorzędową analizę zarówno na urządzeniu jak i z wykorzystaniem chmury. Do podstawowych analiz należą między innymi, konwersja plików BCL, mapowanie odczytów, przyrównanie do sekwencji referencyjnej, sortowanie, określanie stopnia duplikacji oraz oznaczania wariantów. W efekcie, użytkownicy otrzymują dostęp do kompleksowego narzędzia pozwalającego na sekwencjonowanie i interpretację między innymi wyników dla pełnych genomów, eksomów, transkryptomów, fuzji i ekspresji genów bez potrzeby dodatkowych inwestycji w zewnętrzne oprogramowania lub zaangażowania wyspecjalizowanych bioinformatyków.

Specyfikacja

Długość odczytu

NextSeq 1000/2000 *

NextSeq 2000 P3 **

Przepustowość

2 x 50 pz

40 Gb

100 Gb

2 x 100 pz

80 Gb

200 Gb

2 x 150 pz

120 Gb

300 Gb

Jakość odczytów

2 x 50 pz

≥ 85 % zasad powyżej Q30

2 x 100 pz

≥ 80 % zasad powyżej Q30

2 x 150 pz

≥ 75 % zasad powyżej Q30

Czas sekwencjonowania

 

 

2 x 50 pz

~ 13 godzin

~ 19 godzin

2 x 100 pz

~ 21 godzin

~ 33 godziny

2 x 150 pz

~ 29 godzin

~ 48 godzin

*Dostępny w połowie 2020

**Dostępny pod koniec 2020

Powiązane produkty