HIV-1 Whole Genome
HIV-1 Whole Genome to zestaw oparty na amplifikacji całego genomu wirusa metodą RT-PCR, umożliwiający przygotowanie próbek do sekwencjonowania NGS.
Sekwencjonowanie metodą NGS
Pełna analiza genomu wirusa
Zestaw umożliwia amplifikację i sekwencjonowanie pełnego genomu HIV-1, obejmując klasyczne regiony determinujące oporność (PR, RT, IN, V3LOOP), jak i dodatkowe obszary, takie jak: antygen grupowo-swoisty gag, czynnik zakaźności vif, gen nef kodujący białko pomocnicze oraz regiony przylegające do genu kodującego integrazę.
Kompleksowa identyfikacja mutacji
Analiza całego genomu pozwala wykrywać zarówno znane jak i nowe mutacje, umożliwiając pogłębioną ocenę struktury genetycznej wirusa oraz zmian mogących potencjalnie wpływać na skuteczność terapii.
Szybka i prosta analiza bioinformatyczna
Po sekwencjonowaniu dedykowane oprogramowanie, które, korzystają z powszechnie dostępnych baz danych, generuje raport zawierający wszystkie mutacje związane z wirusem HIV-1.
Specyfikacja ogólna
Czas preparatyki | ~ 3,5 h |
Automatyzacja | |
Ilość materiału wejściowego (kopii wirusa) | ≥1000 cp/ml |
Typy próbek | osocze, surowica |
Kompatybilność z systemami | iSeq100, MiSeq, MiSeq i100, MiSeq i100 Plus |
Mechanizm działania | Odwrotna transkrypcja (RT-PCR) |
Rodzaj kwasu nukleinowego | RNA |
Gatunek docelowy | Wirus |