DEEPCHEK®-HPV SOFTWARE (CE-IVD)

DEEPCHEK®-HPV SOFTWARE (CE-IVD)

Oprogramowanie DeepChek®-HPV (CE-IVD) to konfigurowalne oprogramowanie do analizy danych z sekwencjonowania, przeznaczone do wykonywania analiz genomu wirusa brodawczaka ludzkiego (HPV) oraz interpretacji klinicznych.

Kompatybilny z platformami elektroforezy kapilarnej i sekwenatorami nowej generacji (MiSeq, MiniSeq, iSeq-100). Porządkuje dane sekwencjonowania w dedykowanym formacie bazy danych i wykonuje analizy bioinformatyczne dla regionu L1. Generuje raporty do wykorzystania w badaniach lub do rutynowego użytku.

Obsługiwane formaty:
AB1, FASTA i PLAIN-TEXT dla Sanger, FASTA/FASTQ (w tym sekwencjonowanie sparowane), BAM/SAM dla NGS obejmujące geny ukierunkowane lub również kompatybilne z WGS.
Dostępne analizy:
genotypowanie.
Dostępne interpretacje
rokowanie raka szyjki macicy.
Dołączone usługi:
aktualizacje/uaktualnienia (wydania kwartalne), wsparcie, szkolenia internetowe, import danych sekwencjonowania historycznego.
Usługi na żądanie:
szkolenia lokalne, integracja z instrumentami lub systemami innych firm, dostosowywanie do potrzeb użytkownika.

Specyfikacja ogólna

Kompatybilność z platformami sekwencjonowania nowej generacji

Tak, z każdą

Kompatybilność z platformami Sanger

Tak, z każdą

Przeznaczenie

RUO

Obsługiwane pliki

AB1, FASTA i PLAIN-TEXT dla Sanger, FASTA/FASTQ (w tym sekwencjonowanie sparowane), BAM/SAM dla NGS obejmujących geny docelowe lub również kompatybilny z danymi całego genomu

Przepływ pracy

Od danych sekwencjonowania do raportu w ~2 minuty dla SANGER i ~30 minut dla NGS (w zależności od platformy)

Analizowane regiony

L1

Dostępne analizy

Genotypowanie

Dostępne interpretacje

Rokowanie raka szyjki macicy

Dostępne raporty

Raport z genotypowania klinicznego (PDF), 1-stronicowy raport z genotypowania

Wliczone usługi

Nieograniczone aktualizacje oprogramowania, wsparcie, szkolenia.

Dodatkowe opcje

Serwery lokalne, import danych historycznych, integracja
z LIS i HIS, integracja z sekwenatorami, automatyzacja przepływu pracy IT, dostosowywanie do lokalnych potrzeb.

Inne

Bezpieczna platforma internetowa (ograniczenia użytkowników, monitorowanie dostępu), eksport danych, wiele lokalizacji, nieograniczona liczba użytkowników/analiz na witrynę,