DEEPCHEK®-HBV SOFTWARE (CE-IVD)

Oprogramowanie DeepChek®-HBV (CE-IVD) to konfigurowalne oprogramowanie analizy danych z sekwencjonowania, przeznaczone do wykonywania analiz danych genomowych wirusowego zapalenia wątroby typu B (HBV) oraz interpretacji klinicznych.

Kompatybilny z platformami elektroforezy kapilarnej i sekwenatorami nowej generacji (MiSeq, MiniSeq, iSeq-100). Organizuje dane sekwencjonowania w dedykowanym formacie bazy danych i wykonuje analizy bioinformatyczne wraz z interpretacjami klinicznymi dla rejonów Polymerase, HBsAg, Core, Pre-core, Pre-S1, Pre-S2 lub X.
Raporty do wykorzystania w badaniach lub do rutynowego użytku.

Obsługiwane formaty:

AB1, FASTA i PLAIN-TEXT dla Sanger, FASTA/FASTQ (w tym sekwencjonowanie typu PE), BAM/SAM dla NGS obejmujące geny ukierunkowane lub również kompatybilne z WGS.

Dostępne analizy:

genotypowanie/genotypowanie wysokiej rozdzielczości, określanie i walidacja mutacji aminokwasowych/zmian nukleotydów, walidacja pokrycia NGS.

Dostępne interpretacje:

interpretacja lekooporności, ocena uzyskania oporności na szczepionkę przez wirusa, prognoza zaawansowanej choroby wątroby na podstawie kilku aktualnych wytycznych.

Dołączone usługi:

aktualizacje (cykle kwartalne), wsparcie, szkolenia internetowe, import danych sekwencjonowania historycznego.

Usługi na żądanie:

szkolenia lokalne, integracja z instrumentami lub systemami innych firm, dostosowywanie.

Specyfikacja ogólna

Kompatybilność z platformami sekwencjonowania nowej generacji	Tak, z każdą
Kompatybilność z platformami Sanger	Tak, z każdą
Przeznaczenie	CE-IVD (LU/CA01/IVD/69)
Obsługiwane pliki	AB1, FASTA i PLAIN-TEXT dla Sanger, FASTA/FASTQ (w tym sekwencjonowanie sparowane), BAM/SAM dla NGS obejmujących geny docelowe lub również kompatybilny z WGS
Przepływ pracy	Od danych sekwencjonowania do raportu w ~2 minuty dla SANGER i ~30 minut dla NGS (w zależności od platformy)
Obsługiwane regiony	Polimeraza, HBsAg, Core, Pre-core, Pre-S1, Pre-S2, X gen, cały genom
Dostępne analizy	Genotypowanie, genotypowanie wysokiej rozdzielczości, wykrywanie mutacji aminokwasowych, wykrywanie zmian nukleotydowych, raport jakości przebiegu NGS
Dostępne interpretacje	Oporność na leki dzięki różnym aktualnym wytycznym, w tym SeqHepB, ocena uzyskania oporności na szczepionkę przez wirusa, zaawansowanej prognozie choroby wątroby
Dostępne raporty	Genotypowanie, genotypowanie wysokiej rozdzielczości, wykrywanie mutacji aminokwasowych, wykrywanie zmian nukleotydowych, raport jakości przebiegu NGS
Wliczone usługi	Nieograniczone aktualizacje oprogramowania, wsparcie, szkolenia.
Dodatkowe opcje	Serwery lokalne, import danych historycznych, integracja z LIS i HIS, integracja z sekwenatorami, automatyzacja przepływu pracy IT, dostosowywanie do potrzeb użytkownika.
Inne	Bezpieczna platforma internetowa (ograniczenia użytkowników, monitorowanie dostępu), eksport danych, wiele lokalizacji, nieograniczona liczba użytkowników/analiz na witrynę

DEEPCHEK®-HBV SOFTWARE (CE-IVD)

Specyfikacja ogólna

Materiały do pobrania