DEEPCHEK®-CMV SOFTWARE (CE-IVD)

DeepChek® Software-CMV CE-IVD to konfigurowalne oprogramowanie do analizy danych z sekwencjonowania, przeznaczone do wykonywania analiz danych genomowych wirusa Cytomegalovirus (CMV) oraz interpretacji klinicznych.

Kompatybilny z platformami elektroforezy kapilarnej i sekwenatorami nowej generacji jak MiSeq, MiniSeq oraz iSeq-100. Organizuje dane sekwencjonowania w dedykowanym formacie bazy danych i wykonuje analizy bioinformatyczne oraz interpretacje kliniczne UL54 i UL97. Generuje raporty do wykorzystania w badaniach lub do rutynowego użytku.

System oprogramowania DeepChek®-CMV to bezpieczna aplikacja internetowa, z której można korzystać za pośrednictwem chmury lub lokalnie. Jest udostępniany z regularnymi aktualizacjami i uaktualnieniami kwartalnymi oraz może być w pełni zintegrowany z siecią informatyczną każdego laboratorium.

Obsługiwane formaty:

AB1, FASTA i PLAIN-TEXT dla Sanger, FASTA/FASTQ (w tym sekwencjonowanie typu PE), BAM/SAM dla NGS obejmujące geny ukierunkowane lub również kompatybilne z danymi WGS.

Dostępne analizy:

określenie i walidacja mutacji aminokwasowych/zmian nukleotydów, walidacja pokrycia NGS.

Dostępne interpretacje:

interpretacja lekooporności z kilku aktualnych wytycznych

Dołączone usługi:

aktualizacje/uaktualnienia (wydania kwartalne), wsparcie, szkolenia internetowe, import danych sekwencjonowania historycznego.

Usługi na żądanie:

szkolenia lokalne, integracja z instrumentami lub systemami innych firm, dostosowywanie do potrzeb użytkownika.

Specyfikacja ogólna

Kompatybilność z platformami sekwencjonowania nowej generacji	Tak, z każdą
Kompatybilność z platformami Sanger	Tak, z każdą
Przeznaczenie	RUO
Obsługiwane pliki	AB1, FASTA i PLAIN-TEXT dla Sanger, FASTA/FASTQ (w tym sekwencjonowanie typu PE), BAM/SAM dla NGS obejmujących geny docelowe lub również kompatybilny z WGS
Przepływ pracy	Od danych sekwencjonowania do raportu w ~2 minuty dla SANGER i ~30 minut dla NGS (w zależności od platformy)
Obsługiwane regiony	UL54, UL97
Dostępne analizy	Wykrywanie mutacji aminokwasowych, wykrywanie zmian nukleotydowych, raport o jakości przebiegu NGS
Dostępne interpretacje	Lekooporność poprzez różne aktualne wytyczne
Dostępne raporty	Raport z genotypowania klinicznego (PDF), 1-stronicowy raport z genotypowania (wkrótce), raport informacji o jakości zmian aminokwasów (CSV), raport informacji o jakości zmian nukleotydów (CSV)
Wliczone usługi	Nielimitowane aktualizacje oprogramowania oraz wsparcie, szkolenia.
Dodatkowe opcje	Serwery lokalne, import danych historycznych, integracja z LIS i HIS, integracja z sekwenatorami, automatyzacja przepływu pracy IT.
Inne	Bezpieczna platforma internetowa (ograniczenia użytkowników, monitorowanie dostępu), eksport danych, wiele lokalizacji, nieograniczona liczba użytkowników/analiz na witrynę

DEEPCHEK®-CMV SOFTWARE (CE-IVD)

Specyfikacja ogólna

Materiały do pobrania