DEEPCHEK® ASSAY -HIV ASSAY PROTEASE / REVERSE TRANSCRIPTASE GENOTYPING AND DRUG RESISTANCE (CE-IVD)

DEEPCHEK® ASSAY -HIV ASSAY PROTEASE / REVERSE TRANSCRIPTASE GENOTYPING AND DRUG RESISTANCE (CE-IVD)

DeepChek® Assay -HIV Assay Protease / Reverse Transcriptase Genotyping and Drug Resistance do genotypowania HIV-1. Dostarcza informację na temat antyretrowirusowej wrażliwości na inhibitory proteazy (PI) oraz inhibitory odwrotnej transkryptazy (NRTI, NNRTI). Zestaw składa się z odczynników PCR z oprogramowaniem diagnostycznym in vitro, które są kompatybilne z platformami NGS lub Sanger.

Specyfikacja ogólna

Kompatybilność z platformami do NGS

Tak, z każdą

Kompatybilność z platformami do elektroforezy kapilarnej

Tak, z każdą

Przeznaczenie  

CE-IVD – ISO-9001

Liczba reakcji

24 próbek/zestaw

Rodzaj materiału wejściowego

Surowica, osocze, DNA prowirusowe, DBS

Zawartość zestawu

Odczynniki RT-PCR i Nested-PCR (enzymy, mastermiksy, startery, dNTP), startery do sekwencjonowania SANGER, protokoły do sekwencjonowania SANGER i NGS, analizy oprogramowania SANGER lub NGS dla 24 próbek poprzez dostęp do chmury

 

Czułość

1000 cp/ml dla 400 µl osocza/surowicy. Dostępne protokoły dla niskiego miana wirusa (>200 - 300 cp/ml)

Specyficzność

Zwalidowany na większości podtypów i szczepów CRF

Powtarzalność

>99%

Przepływ pracy

Od próbki do wyniku ~15 godzin dla SANGER i ~30 godzin dla NGS (w zależności od platformy)

Pokrycie

PR: kodony od 1 do 99, RT: kodony od 1 do 320

Kompatybilne metody ekstrakcji

Automatyczny (zestaw do izolacji kwasów nukleinowych MagNA Pure Compact I - Roche, Promega - Abbott), ręczny (ręczne ekstrakcje przy użyciu QIAamp® Viral RNA - Qiagen)...

Oprogramowanie do analizy i interpretacji danych

W zestawie (DeepChek-HIV / CE-IVD)

Dostępne analizy

Podtypowanie, wykrywanie mutacji aminokwasowych, wykrywanie zmian nukleotydowych, lekooporność, raport jakości przebiegu NGS, GSS, raport z genotypowania klinicznego

Lekooporność

Elastyczny dzięki aż 7 różnym aktualnym wytycznym, w tym HIVdb/Stanford, ANRS, geno2pheno, Rega

Wliczone usługi

Nieograniczone aktualizacje oprogramowania, wsparcie, szkolenia

Opcje

Serwery lokalne, import danych historycznych, integracja z LIS i HIS, integracja z sekwenatorami, automatyzacja przepływu pracy IT.

Materiały do pobrania