AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3
AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3 to zestaw pozwalający na profilowanie wariantów somatycznych w 161 genach, związanych z różnymi typami nowotworów.
Analiza 161 genów związanych z różnymi rodzajami nowotworów
Kompleksowa analiza genów
Panel służy do celowanej analizy DNA i RNA w kierunku wykrycia wariantów w 161 genach, powiązanych z chorobami nowotworowymi, w tym domen kinaz oraz genów zaangażowanych w naprawę DNA.
Krótki czas przygotowania bibliotek
Czas przygotowania bibliotek nie przekracza jednego dnia. Ilość materiału wejściowego do protokołu to zaledwie 1 ng wysokiej jakości DNA lub 10 ng DNA z próbek FFPE.
Analiza danych
Zastosowanie lokalnego lub chmurowego oprogramowania bioinformatycznego umożliwia wykrycie mutacji somatycznych, o progu częstości 5%.
Specyfikacja ogólna
|
Czas preparatyki |
5-6 h |
|
Czas pracy manualnej |
< 1,5 h |
|
Ilość materiału wejściowego |
1 – 100 ng |
|
Liczba reakcji |
24 |
|
Rodzaj materiału wejściowego |
FFPE |
|
Kompatybilność z systemami |
NextSeq 1000, NextSeq 2000, NextSeq 550, NextSeq 550Dx (moduł naukowy) |
|
Rodzaj kwasu nukleinowego |
DNA, RNA |
|
Typy wariantów |
CNVs, fuzje genowe, insercje-delecje (indels), SNPs, warianty somatyczne |
|
Gatunek |
Człowiek |
|
Metodyka |
Sekwencjonowanie amplikonowe |
|
Technologia |
Sekwencjonowanie |