AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3
AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3 to zestaw pozwalający na profilowanie wariantów somatycznych w 161 genach, związanych z różnymi typami nowotworów.
Analiza 161 genów związanych z różnymi rodzajami nowotworów
Kompleksowa analiza genów
Panel służy do celowanej analizy DNA i RNA w kierunku wykrycia wariantów w 161 genach, powiązanych z chorobami nowotworowymi, w tym domen kinaz oraz genów zaangażowanych w naprawę DNA.
Krótki czas przygotowania bibliotek
Czas przygotowania bibliotek nie przekracza jednego dnia. Ilość materiału wejściowego do protokołu to zaledwie 1 ng wysokiej jakości DNA lub 10 ng DNA z próbek FFPE.
Analiza danych
Zastosowanie lokalnego lub chmurowego oprogramowania bioinformatycznego umożliwia wykrycie mutacji somatycznych, o progu częstości 5%.
Specyfikacja ogólna
Czas preparatyki | 5-6 h |
Czas pracy manualnej | < 1,5 h |
Ilość materiału wejściowego | 1 – 100 ng |
Liczba reakcji | 24 |
Rodzaj materiału wejściowego | FFPE |
Kompatybilność z systemami | NextSeq 1000, NextSeq 2000, NextSeq 550, NextSeq 550Dx (moduł naukowy) |
Rodzaj kwasu nukleinowego | DNA, RNA |
Typy wariantów | CNVs, fuzje genowe, insercje-delecje (indels), SNPs, warianty somatyczne |
Gatunek | Człowiek |
Metodyka | Sekwencjonowanie amplikonowe |
Technologia | Sekwencjonowanie |