AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3

AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3

AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3 to zestaw pozwalający na profilowanie wariantów somatycznych w 161 genach, związanych z różnymi typami nowotworów.

Analiza 161 genów związanych z różnymi rodzajami nowotworów
Kompleksowa analiza genów
Panel służy do celowanej analizy DNA i RNA w kierunku wykrycia wariantów w 161 genach, powiązanych z chorobami nowotworowymi, w tym domen kinaz oraz genów zaangażowanych w naprawę DNA.
Krótki czas przygotowania bibliotek
Czas przygotowania bibliotek nie przekracza jednego dnia. Ilość materiału wejściowego do protokołu to zaledwie 1 ng wysokiej jakości DNA lub 10 ng DNA z próbek FFPE.
Analiza danych
Zastosowanie lokalnego lub chmurowego oprogramowania bioinformatycznego umożliwia wykrycie mutacji somatycznych, o progu częstości 5%.

Specyfikacja ogólna

Czas preparatyki

5-6 h

Czas pracy manualnej

< 1,5 h

Ilość materiału wejściowego     

1 – 100 ng

Liczba reakcji

24

Rodzaj materiału wejściowego

FFPE

Kompatybilność  z systemami   

NextSeq 1000, NextSeq 2000, NextSeq 550, NextSeq 550Dx (moduł naukowy)

Rodzaj kwasu nukleinowego

DNA, RNA

Typy wariantów

CNVs, fuzje genowe, insercje-delecje (indels), SNPs, warianty somatyczne

Gatunek

Człowiek

Metodyka

Sekwencjonowanie amplikonowe

Technologia

Sekwencjonowanie