AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2
AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2 to zestaw do badania mutacji somatycznych w regionach typu hotspot 50 genów, których powiązania z procesami nowotworowymi zostały naukowo potwierdzone i skatalogowane w bazie COSMIC.
Analiza ok. 2800 mutacji dla 50 onkogenów i genów supresorowych guzów litych
Kompleksowa analiza genów
Zestaw umożliwia analizę ok. 2800 mutacji COSMIC pochodzących z 50 onkogenów i genów supresorowych guzów litych.
Krótki czas przygotowania bibliotek
Czas przygotowania bibliotek nie przekracza jednego dnia. Ilość materiału wejściowego do protokołu to zaledwie 1 ng wysokiej jakości DNA, izolowanego z krwi lub 10 ng DNA z próbek FFPE
Analiza danych
Zastosowanie lokalnego lub chmurowego oprogramowania bioinformatycznego umożliwia wykrycie mutacji somatycznych, o progu częstości 5%.
Specyfikacja ogólna
|
Czas preparatyki |
5 h |
|
Czas pracy manualnej |
< 1,5 h |
|
Ilość materiału wejściowego |
1-100 ng |
|
Liczba reakcji |
24 |
|
Rodzaj materiału wejściowego |
FFPE |
|
Kompatybilność z systemami |
iSeq100, MiniSeq, MiSeq, MiSeqDx (moduł naukowy), |
|
Rodzaj kwasu nukleinowego |
DNA |
|
Typy wariantów |
insercje-delecje (indels), SNPs, warianty somatyczne |
|
Gatunek |
Człowiek |
|
Metodyka |
Sekwencjonowanie amplikonowe |
|
Technologia |
Sekwencjonowanie |