AlloSeq HCT

AlloSeq HCT

AlloSeq HCT jest rozwiązaniem, umożliwiającym analizy chimeryzmu z wykorzystaniem technologii sekwencjonowania następnej generacji. Badanie genetyczne chimeryzmu ma istotne znaczenie między innymi w zabiegach przeszczepów komórek krwiotwórczych, pozwalając na monitorowanie i ocenę ryzyka odrzucenia przeszczepu.
Wynik w ciągu 24 godzin
Pełna procedura składa się z między innymi z przygotowania bibliotek NGS z wykorzystaniem PCR typu multipleks, znakowania poszczególnych próbek oraz sekwencjonowania na urządzeniu MiSeq, Illumina. Czas poświęcony na procedurę przygotowania bibliotek, sekwencjonowanie oraz przygotowanie raportu wynosi 24 godziny, w tym praca manualna zajmuje około 2 godzin.
Wysoka czułość testu i powtarzalność wyników
W przeciwieństwie do innych rozwiązań analizujących chimeryzm w oparciu o STR, AlloSeq HCT zaprojektowano z wykorzystaniem polimorfizmów typu SNP, w efekcie uzyskując większą czułość badania. Potwierdzona badaniami granica wykrywalności to 0,3% DNA określonego genomu.
Ocena procentowej zawartości do 3 genomów w danej próbce
Badanie AlloSeq HCT pozwala określić procentowy udział DNA dla nawet 3 genomów w jednej próbce, co może być przydatne w przypadku ponownego przeszczepiania.
Dedykowane do panelu AlloSeq HCT intuicyjne oprogramowanie
Przyjazne dla użytkownika oprogramowanie AlloSeq HCT umożliwia automatyczne określanie loci uwzględnionych w panelu, obliczanie poziomu chimeryzmu oraz monitorowanie w czasie, wyników danego pacjenta.

Specyfikacja ogólna

Czas preparatyki

 3-4 h

Czas pracy manualnej

 2 h

Ilość materiału wejściowego     

10 ng wysokiej jakości DNA

Liczba reakcji

24

Rodzaj materiału wejściowego

Krew

Kompatybilność  z systemami   

MiSeq, MiSeqDx (tryb naukowy)

Rodzaj kwasu nukleinowego

DNA,

Typy wariantów

SNPs,

Gatunek

Człowiek

Metodyka

Sekwencjonowanie amplikonowe

Technologia

Sekwencjonowanie