Nowe funkcje w sekwenatorach NovaSeq™ X i X Plus
Illumina rozszerza możliwości sekwenatorów z serii NovaSeq X o trzy nowe funkcje, które odpowiadają na realne wyzwania laboratoriów zajmujących się sekwencjonowaniem. Usprawnienia pomogą zmaksymalizować możliwości sekwenatorów NovaSeq X, skracając czas przestojów i zwiększając przepustowość analiz przy jednoczesnym obniżeniu kosztów operacyjnych.
- autodetect Indices — automatyczne wykrywanie i korekta indeksów
Funkcja automatyzuje identyfikację indeksów bezpośrednio podczas przebiegu sekwencjonowania. System analizuje sekwencje od razu po zakończeniu odczytu „Index 2”, umożliwiając wykrycie i korektę potencjalnych niezgodności jeszcze przed zakończeniem sekwencjonowania – bez potrzeby ręcznej interwencji i czasochłonnej analizy błędów po fakcie.
- zestaw 1.5B 600-cycle — większa wydajność dla shotgun metagenomics
Nowy zestaw 1.5B 600 cykli dla NovaSeq X/X Plus został zaprojektowany z myślą o wymagających aplikacjach, takich jak sekwencjonowanie metagenomiczne typu shotgun, gdzie kluczowe znaczenie mają zarówno długie odczyty, jak i wysokie pokrycie. Chemia ta zapewnia wysoką ilość generowanych danych przy jednoczesnej wyraźnej jakości odczytów i niskim poziomie duplikatów, co przekłada się na większe efektywne pokrycie filtrach. W efekcie składanie genomów de novo jest dokładniejsze a identyfikacja mikroorganizmów jest lepsza, co przekłada się na wyższą wiarygodność analiz metagenomicznych.
- staggered Start — niezależna praca modułów sekwencjonowania
NovaSeq X Plus wyposażony jest w dwa niezależne moduły sekwencjonowania, z których każdy posiada holder na komorę przepływową. Dotychczas uruchomienie runu w jednym module blokowało możliwość rozpoczęcia pracy w drugim aż do zakończenia sekwencjonowania, co mogło oznaczać nawet kilkudziesięciogodzinny przestój.
Dzięki staggered start każdy moduł może być uruchamiany niezależnie - bez względu na to, czy drugi prowadzi aktywny run, przechodzi procedurę mycia czy pozostaje w trybie gotowości.
Przekłada się to na większą swobodę w organizacji pracy laboratorium – mniejsze partie próbek można uruchamiać bez zbędnego oczekiwania na zapełnienie komórki przepływowej, a przepustowość instrumentu jest wykorzystywana efektywniej. Rozwiązanie sprawdza się szczególnie tam, gdzie próbki napływają nieregularnie lub gdy projekt wymaga natychmiastowej analizy.