Mykobiom – niedoceniana część mikrobiomu?

Mykobiota to ogół grzybów, które naturalnie zasiedlają organizm człowieka, bytując głównie w jelitach, jamie ustnej, na skórze oraz w układzie rozrodczym i oddechowym. Choć stanowi niewielki odsetek całego mikrobioty, jego zaburzenia ilościowe i jakościowe mogą mieć istotny wpływ na zdrowie, przyczyniając się do rozwoju chorób oraz stanów zapalnych.

Zaburzenia równowagi mykobioty wiązane są m.in. z chorobami jelit, takimi jak nieswoiste zapalenia jelit (IBD) czy zespół jelita drażliwego (IBS). Coraz więcej badań wskazuje również, że mogą być one powiązane z rozwojem raka jelita grubego, gdzie przewlekłe stany zapalne sprzyjają procesom kancerogenezy. Grzyby odgrywają także rolę w metabolizmie składników odżywczych, takich jak cukry i tłuszcze, co może wpływać na rozwój chorób metabolicznych, w tym otyłości i cukrzycy typu 2. Ich znaczenie obserwuje się również m.in. w chorobach układu oddechowego czy schorzeniach dermatologicznych.

Zastosowanie badań mykobiomu (czyli zbioru genów mykobioty) w diagnostyce stale rośnie, obejmując takie dziedziny jak immunologia, gastroenterologia, onkologia, dermatologia, ginekologia czy pulmonologia. Dotychczas analizy te opierały się głównie na technikach hodowlanych, które są czasochłonne i charakteryzują się ograniczoną czułością. Coraz większe znaczenie zyskują metody oparte na Next-Generation Sequencing (NGS), które umożliwiają analizę szerokiego spektrum mikroorganizmów bez konieczności ich hodowli, zapewniając wysoką czułość, powtarzalność oraz obiektywność wyników.

Firma Arrow Diagnostics oferuje zestaw Mycobiota Solution jako rozwiązanie do analizy mykobioty. Badanie obejmuje fragment ITS1 grzybowego rDNA. Szeroki zakres kompatybilnych typów próbek pozwala na jego zastosowanie w różnych obszarach badawczych i klinicznych. Protokół przygotowania bibliotek jest prosty i możliwy do przeprowadzenia w ciągu jednego dnia. Dla laboratoriów, które prowadzą już badania mikrobiomu metodą NGS, Mycobiota Solution stanowi praktyczne rozszerzenie dotychczasowych analiz, bez konieczności zmiany stosowanej infrastruktury czy podejścia do pracy.