MultiPro Human Discovery Panel firmy 10x Genomics – jednoczesna analiza transkryptów i białek

Analiza RNA nie zawsze pozwala w pełni scharakteryzować stan komórki. Aktywność szlaków sygnałowych, fosforylacja czy obecność markerów powierzchniowych są związane z poziomem białek. Połączenie danych o transkryptach i białkach może więc poszerzyć obraz funkcjonowania komórek oraz pomóc lepiej zrozumieć mechanizmy chorób i odpowiedź na leczenie.
Panel MultiPro Human Discovery umożliwia jednoczesne profilowanie RNA i białek w ramach protokołu Flex Apex scRNA-seq. Obejmuje 347 przeciwciał znakowanych kodami DNA i pozwala analizować do 326 celów białkowych. Panel można włączyć do istniejącego protokołu Flex Apex, dzięki czemu w jednym eksperymencie można
uzyskać informacje o ekspresji genów oraz o białkach powierzchniowych i wewnątrzkomórkowych z tych samych komórek.
Panel obejmuje m.in. cytokiny, czynniki transkrypcyjne, fosfoproteiny oraz inne białka związane z funkcjonowaniem komórek. Umożliwia analizę stanu aktywacji i szlaków sygnalizacyjnych poprzez połączenie danych dotyczących ekspresji genów z informacjami o poziomie białek. Liofilizowane odczynniki jednorazowego użytku ułatwiają przygotowanie eksperymentu i wspierają powtarzalność kolejnych analiz.
Flex Apex umożliwia pracę w trybach singleplex i multiplex. W trybie singleplex można efektywnie partycjonować od 500 do 20 000 komórek na kanał, analizując do 8 próbek i 160 000 komórek na chip. Tryb multiplex umożliwia multipleksowanie do 384 próbek i 1 000 000 komórek na kanał; w zależności od konfiguracji można przeanalizować od 1 do 3 072 próbek lub do 8 milionów komórek na chip. Multipleksowanie oparte na płytkach 96-dołkowych, z wykorzystaniem pipet wielokanałowych, ogranicza liczbę czynności manualnych. Rozwiązanie nie ma dolnego limitu wielkości komórek i jest kompatybilne z różnymi typami materiału, w tym tkankami oraz komórkami świeżymi, mrożonymi i utrwalonymi w PFA, a także próbkami FFPE.
Więcej informacji