Modyfikacje kitu Reveal ctDNA 28 firmy Archer Dx.
Archer Dx, producent rozwiązań dedykowanych diagnostyce molekularnej nowotworów poinformował w ostatnim czasie o zmianie nazwy jednego ze swoich produktów – Reveal ctDNA 28. Od tej pory, kit do analizy mutacji w oparciu o ctDNA, widnieje pod nazwą LiquidPlex for Illumina. Kluczowe cechy tego zestawu to między innymi :
- Technologia AMP (Anchored Multiplex PCR) umożliwiająca preferencyjne wzbogacanie fragmentów ctDNA w stosunku do genomowego cfDNA, powodująca w efekcie wzrost wykrywalności alleli występujących z niską częstotliwością;
- Integracja sekwencji UMI (Unique Molecular Identifiers) z procedurami przygotowania bibliotek NGS przekłada się efektywną korektę błędów powstałych na etapie PCR lub sekwencjonowania;
- Detekcja wariantów występujących z niską częstotliwością (1%) przy wykorzystaniu niewielkiej ilości materiału wejściowego (10ng);
- Całkowity czas potrzebny na przygotowanie biblioteki to mniej niż 8 godzin.
Dodatkowym atutem tego rozwiązania jest możliwość zastosowania go w połączeniu z Archer VariantPlex oraz Archer PreSeq DNA QC Assay. Dzięki LiqudPlex Concordnance Panel, użytkownicy mogą uzyskać szersze spektrum detekcji wariantów genetycznych: mutacje somatyczne analizowane na podstawie materiału pochodzącego z tkanki nowotworowej (między innymi CNV) a także mutacje dla 28 genów w oparciu o ctDNA (SNV/indel). Archer PreSeq DNA QC z kolei umożliwia określenie jakości materiału pochodzącego z FFPE przed przystąpieniem do etapu przygotowania bibliotek NGS.