MiSeq i100 oraz i100 Plus – nowe możliwości sekwencjonowania i analizy danych na pokładzie

Sekwenatory MiSeq i100 i MiSeq i100 Plus Illumina zostały rozbudowane o nowe funkcje, które znacząco zwiększają ich elastyczność i wydajność. Ostatnie aktualizacje obejmują:

• MiSeq i100 Series 25M Reagent Kit (1000 cycles) – zestaw umożliwia sekwencjonowanie z odczytami do 2 × 500 pz, zapewniając uzyskanie do 25 Gb danych z jednej flow cell. Czas sekwencjonowania wynosi około 24 godziny, przy zachowaniu wysokiej jakości danych – co najmniej 85% zasad osiąga wartość Q30, co odpowiada dokładności 99,9%.
• 5 nowych aplikacji DRAGEN do analizy danych bezpośrednio na sekwenatorze:
  • DRAGEN Microbial Amplicon – aplikacja dedykowana analizom związanym z detekcją i nadzorem nad patogenami. Kompatybilna z protokołami Illumina Microbial Amplicon Prep, Illumina Microbial Amplicon Prep—Influenza A/B oraz Illumina COVIDSeq Assay.
  DRAGEN RNA – wspiera analizy transkryptomiczne, w tym sekwencjonowanie mRNA i profilowanie ekspresji genów. Współdziała z protokołami Illumina Stranded mRNA Prep oraz panelami AmpliSeq for Illumina.
  • DRAGEN 16S Plus – narzędzie przeznaczone do sekwencjonowania amplikonu 16S rRNA, powszechnie wykorzystywanego w identyfikacji i klasyfikacji mikroorganizmów w próbkach różnego pochodzenia.
  • DRAGEN Amplicon – obsługuje sekwencjonowanie amplikonowych paneli celowanych, stosowanych m.in. w badaniach edycji genomu i onkologii. Kompatybilny z zestawami AmpliSeq for Illumina oraz panelami oncoReveal NGS.
  • DRAGEN Enrichment – zaprojektowany do analiz bibliotek wzbogacanych sondami hybrydyzacyjnymi, takich jak Illumina DNA Prep with Enrichment.

Wymienione aplikacje są dostępne w cenie instrumentu i nie wymagają dodatkowych licencji. Użytkownicy mogą również przesyłać dane do chmury BaseSpace Sequence Hub, gdzie dostępny jest pełen pakiet aplikacji DRAGEN wraz z narzędziami do wizualizacji wyników, lub korzystać z platformy Illumina Connected Analytics w przypadku bardziej zaawansowanych, skalowalnych analiz.

Więcej informacji