Warsztat nr 2: 10x Genomics. Od obrazów do wyników – praktyczna analiza danych z transkryptomiki przestrzennej

Serdecznie zapraszamy do wzięcia udziału w warsztacie w ramach corocznego spotkania 10x Genomics!

Data: 9 października 2025 od 9:00 do 16:00

Miejsce: Centrum Nauk Biologiczno-Chemicznych Uniwersytetu Warszawskiego

Ul. Żwirki i Wigury 101, 02-089 Warszawa

Aula C

Podczas spotkania na podstawie przykładowego eksperymentu uczestnicy poznają proces analizy danych transkryptomiki przestrzennej Visium HD. Zaczniemy od obróbki surowych danych, a następnie ocenimy ich jakość i przejdziemy do szczegółowej eksploracji oraz mapowania typów komórek. Na koniec każdy uczestnik będzie miał okazję omówić własny plan dalszych analiz z ekspertami z 10x Genomics.

Uczestników warsztatów prosimy o zabranie ze sobą komputerów. Na kilka dni przed spotkaniem prześlemy e-mail ze szczegółowymi informacjami, jak przygotować się do warsztatów.

Serdecznie zapraszamy!

Uprzejmie informujemy, że ze względu na ograniczoną liczbę miejsc, udział w warsztatach zostanie potwierdzony w osobnym e-mailu po przesłaniu zgłoszenia.

Przycisk: Zgłoś udział

Agenda

9:00 Rejestracja i poranna kawa

9:30 – 12:00 Sesja poranna
 • Wprowadzenie
 • Przegląd analizy danych przestrzennych Visium HD
 • 10x Cloud Analysis: od plików FASTQ do ilościowych informacji biologicznych z użyciem Space Ranger dla Visium HD
 • Ocena jakości: interpretacja podsumowania w Space Ranger

12:00 – 13:00 Lunch

13:00 – 15:30 Sesja popołudniowa
 • Loupe Browser: eksploracja danych i mapowanie typów komórek
 • Wprowadzenie do zewnętrznych metod analizy danych Visium
 • Dalsze analizy z wykorzystaniem narzędzi zewnętrznych – na przykład GSEA
 • Podsumowanie i sesja Q&A z zespołem 10x Genomics