Warsztat nr 1: 10x Genomics. Od danych do wyników - praktyczna analiza single-cell

Serdecznie zapraszamy do wzięcia udziału w warsztacie w ramach corocznego spotkania 10x Genomics!

Data: 7 października 2025 od 9:00 do 16:00

Miejsce: Centrum Nauk Biologiczno-Chemicznych Uniwersytetu Warszawskiego

Ul. Żwirki i Wigury 101, 02-089 Warszawa

Aula C

Podczas spotkania uczestnicy poznają pełną ścieżkę analizy danych ekspresji genów na poziomie pojedynczych komórek. Zaczniemy od krótkiego wprowadzenia do projektowania eksperymentów, a następnie na podstawie przykładowych wyników przejdziemy przez etapy obróbki surowych danych, ocenę ich jakości oraz pierwsze kroki analizy wyników. Uczestnicy zobaczą, jak przełożyć dane biologiczne na praktyczne wnioski badawcze, a na zakończenie będą mieli okazję omówić własne pomysły i kierunki dalszych analiz z zespołem bioinformatyków.

Uczestników warsztatów prosimy o zabranie ze sobą komputerów. Na kilka dni przed spotkaniem prześlemy e-mail ze szczegółowymi informacjami, jak przygotować się do warsztatów.

Uprzejmie informujemy, że ze względu na ograniczoną liczbę miejsc, udział w warsztatach zostanie potwierdzony w osobnym e-mailu po przesłaniu zgłoszenia.

Przycisk: Zgłoś udział

Agenda

9:00 Rejestracja i poranna kawa

9:30 – 12:00 Sesja poranna
 • Wprowadzenie do warsztatów i sprawy organizacyjne
 • 10x Genomics Cloud Analysis: od plików FASTQ do ilościowych informacji biologicznych z użyciem Cell Ranger
 • Przerwa (15 minut)
 • Wprowadzenie do analizy danych Single Cell RNA-seq
 • Ocena jakości: interpretacja podsumowania w Cell Ranger

12:00 – 13:00 Lunch

13:00 – 15:30 Sesja popołudniowa
 • Analiza w Loupe: kontrola jakości i szybka eksploracja danych
 • Przerwa (15 minut)
 • Eksploracja zewnętrznych metod/algorytmów do analizy: RNA velocity
 • Podsumowanie i sesja Q&A z zespołem 10x Genomics