VARIANTPlex® Comprehensive Thyroid & Lung
Analiza 31 genów związanych z nowotworami płuc i tarczycy
VARIANTPlex® CTL to naukowy panel NGS, który wykrywa i charakteryzuje warianty pojedynczych nukleotydów (SNV), warianty liczby kopii (CNV) oraz insercje/ delecje (indels) w 31 genach, powiązanych z występowaniem nowotworów płuc oraz tarczycy.
Zestaw wykorzystuje technologię AMP™ (Anchored Multiplex PCR) gdzie każda z cząsteczek DNA zostaje specjalnie oznakowana, dzięki czemu proces korekcji błędów na etapie analizy bioinformatycznej (prawdziwa mutacja vs błędy powstałe podczas sekwencjonowania) staje się bardziej skuteczna. Zestaw pokrywa eksony wybranych genów z wysokim wskaźnikiem równomierności (>95%) a także odczytów „on-target” (99,9%).
W skład VARIANTPlex CTL wchodzą: specyficzne startery do amplifikacji wskazanych regionów, enzymy w postaci zliofilizowanej, odczynniki do przygotowania gotowych bibliotek a także dodatkowe odczynniki do oceny jakości materiału wyjściowego – Archer PreSeq DNA QC Assay. Analiza wyników odbywa się z wykorzystaniem programu Archer Analysis.
Specyfikacja ogólna
Liczba genów | 31 |
Rodzaj kwasu nukleinowego | DNA |
Ilość materiału wejściowego | ≥ 10 ng |
Rodzaj próbki | Materiał świeży oraz FFPE |
Rozmiar analizowanego regionu | ok. 21,6 kb |
Równomierność pokrycia | >20% średniego pokrycia dla >97% |
Czas pracy manualnej | 2,5 h |
Łączny czas protokołu | 1 dzień |
Kompatybilna platforma | Illumina® |
Minimalna rekomendowana liczba odczytów na próbkę | 1 M |