AlloSeq Tx8
AlloSeq Tx 8 to innowacyjne rozwiązanie NGS dla laboratoriów zajmujących się typowaniem antygenów HLA, które charakteryzuje się najszerszą paletą poddawanych analizie genów (17 loci). AlloSeq Tx8 wykorzystuje rekcję hybrydyzacji z sondami i wyłapywania (Hybrid Capture), co eliminuje ograniczenia tradycyjnych metod Long-Range PCR.
Protokół AlloSeq Tx8 składa się z 4 etapów: enzymatycznej fragmentacji DNA przy użyciu transpozazy znajdującej się na kulkach, zapewniając równomierne cięcie gDNA, poprzedzonego pulowaniem prób wzbogacania (enrichment), sekwencjonowania bibliotek oraz analizy danych przy użyciu dedykowanego oprogramowania. Czas pracy manualnej to ok. 4 godziny.
Zastosowanie technologii Hybrid Capture eliminuje ryzyko nierównomiernego pokrycia sekwencji docelowych oraz zjawisko „drop-out” określonych fragmentów genów.
Wykorzystanie oprogramowania AlloSeq Assign dedykowanego dla bibliotek AlloSeqTx gwarantuje przygotowanie raportu z wyników sekwencjonowania (pula 24 prób) w czasie do 30 minut.
Specyfikacja ogólna
|
Czas preparatyki |
8 h |
|
Czas pracy manualnej |
4 h |
|
Ilość materiału wejściowego |
> 50 ng |
|
Liczba reakcji |
384 |
|
Rodzaj materiału wejściowego |
Krew |
|
Kompatybilność z systemami |
iSeq100, MiniSeq, MiSeq, MiSeqDx (tryb naukowy) |
|
Rodzaj kwasu nukleinowego |
DNA |
|
Gatunek |
Człowiek |
|
Metodyka |
Wzbogacenie próbek (enrichment) |
|
Technologia |
Sekwencjonowanie |
|
Automatyzacja |
Automatyczne stacje pipetujące |