Konsolidacja analizy markerów molekularnych mogących decydować o celowanym leczeniu nowotworów.

Serdecznie zapraszamy Państwa do zapoznania się z broszurą udostępnioną przez firmę Illumina, dotyczącą porównania dwóch odrębnych ścieżek analizy markerów molekularnych stosowanych w onkologii. Pierwsze podejście zakłada pozyskiwanie danych na zasadzie iteracyjnego weryfikowania postawionych hipotez. Każda kolejna hipoteza może odnosić się do wykorzystywanej metody (PCR,IHC,FISH, sekwencjonowanie metodą Sanger’a) a także rodzaju poszukiwanej zmiany genetycznej (indel, fuzja genów, CNV itp.). Drugie podejście, z wykorzystaniem sekwencjonowania następnej generacji, zakłada pełną konsolidację, pozwalającą na przetestowanie wielu postawionych hipotez w jednym eksperymencie.

W udostępnionej broszurze dowiedzą się Państwo miedzy innymi jak obie te metody odnoszą się do kwestii:

  • czasu od pozyskania próbki do przekazania wyniku użytecznego w doborze odpowiedniego leczenia,
  • ograniczeń związanych z dostępnością materiału do badań,
  • ryzyka generowania błędów popełnianych przez użytkowników,
  • kosztów związanych z utrzymaniem aparatury badawczej i wykorzystywania odczynników,
  • ozyskiwania informacji które pozwalają spojrzeć na problem z szerszej perspektywy.

 

Serdecznie zapraszamy do lektury : Target-seq